Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15394
- Subject:
- NM_001365792.1
- Aligned Length:
- 1679
- Identities:
- 1365
- Gaps:
- 286
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGGGGTTCCCACCAGC---------------------------------CAAA--------------- 322
||||||||||| |||..|||| ||||
Sbjct 297 GAAGACAGGGG--CCCTTCAGCATCATCATGCTGTTCATGAAATATCCTACATTGCAAAGGACATTACAGATCA 368
Query 323 -----------------------AGAAGGAAGGTG---------TTTATGATGTGCCAAAAA------------ 352
.||||||||| | |||.|| ||||.|||
Sbjct 369 CCGGGCCTTTGGATATGTTTGTGGGAAGGAAGG-GAATCACAGATTTGTG----GCCATAAAAACAGCCCAGGC 437
Query 353 --GTCAACCTGT-----------------------------------------------------AAGTAAT-- 369
.|.||||||| ||| |||
Sbjct 438 GGCTGAACCTGTTATTCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATTTATGAATTGAAGCAAAGAGAAG-AATTA 510
Query 370 --------GGC-----------------------------------------TATTCGTTTGAGGATTTTGAAG 394
||| |||| |...||||||.||||||
Sbjct 511 GAAAAAAAGGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACAATATT-GGAAGAGGATGTTGAAG 583
Query 395 AAC------------------GGTTTGCTGC--------AGCCA---------CCCCGAACAGAA--------- 424
|.| .|||||..|| ||||| |||..|||.|||
Sbjct 584 ATCCTGTGTACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACACGAGCCAATCCGTGATCCCGAAACGGAAGAAAACATT 657
Query 425 ------------ACCTGCCCACAGA--------CTTTGATGAGATTTTTG------AGGCAAC---GAAG-GCT 468
|||.|||.|.||| .||| |||| |.|| ||.|||| .||| |||
Sbjct 658 TATCAGGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTT-ATGA----TGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTGCT 726
Query 469 GTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCC 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 727 GTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCCCCCACTCCTGCAACTCC 800
Query 543 AGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCG 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 AGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCG 874
Query 617 GCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTC 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 GCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTC 948
Query 691 GTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATG 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 GTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATG 1022
Query 765 GGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCT 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 GGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCT 1096
Query 839 TCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTC 912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 TCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTC 1170
Query 913 CCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTT 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 CCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTT 1244
Query 987 TAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCT 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 TAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCT 1318
Query 1061 CAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATC 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 CAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATC 1392
Query 1135 TCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACA 1466
Query 1209 GAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTG 1282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1467 GAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTG 1540
Query 1283 AAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGT 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 AAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGT 1614
Query 1357 GAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC 1407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 GAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC 1665