Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15394
• Subject: XM_006502726.1
• Aligned Length: 1764
• Identities: 1287
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGG-----------------------------------------------------------------  305
            ||||||.||                                                                 
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  445  CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA  518

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  519  GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT  592

Query  306  ----------------------------------------------------------------------GGTT  309
                                                                                  ||||
Sbjct  593  ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT  666

Query  310  CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|.||
Sbjct  667  CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATAGCCAGCCGCTGGA  740

Query  384  GGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACCCCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGG  457
            ||||||.||....||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||
Sbjct  741  GGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACGCCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGG  814

Query  458  CAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACT  531
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||
Sbjct  815  CAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACT  888

Query  532  CCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTC  605
            ||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.||
Sbjct  889  CCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTC  962

Query  606  TGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTC  679
            |.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  TATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCC  1036

Query  680  AGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAG  753
            ||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1037  AGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAG  1110

Query  754  CCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCC  827
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  CCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCC  1184

Query  828  GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC  901
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC  1258

Query  902  TTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGC  975
            ||||.||||||||||||||||.||||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  TTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGG  1332

Query  976  AAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCT  1049
            ||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCT  1406

Query 1050  CACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG  1123
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG  1480

Query 1124  ACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCA  1197
            ||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCA  1554

Query 1198  GCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGA  1271
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 1555  GCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGA  1628

Query 1272  AGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTG  1345
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1629  AGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAAGCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTG  1702

Query 1346  ATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC  1407
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1703  ATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAAGACGGTAGC  1764