Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15394
• Subject: XM_011240432.2
• Aligned Length: 1659
• Identities: 1281
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGG-----------------------------------------------------------------  305
            ||||||.||                                                                 
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  445  CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA  518

Query  306  ---------------------------------------GGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG  340
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG  592

Query  341  ATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGAGGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACC  414
            |||||||||||||||||||      ||||.||.|..||.|.||||||||.||....||.|||||.||||||||.
Sbjct  593  ATGTGCCAAAAAGTCAACC------TAATAGCCAGCCGCTGGAGGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACG  660

Query  415  CCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT  488
            ||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGGCAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT  734

Query  489  TGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCAT  562
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.|
Sbjct  735  TGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGT  808

Query  563  CTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA  636
            |.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA  882

Query  637  GGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCAT  710
            |||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||
Sbjct  883  GGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCAT  956

Query  711  GGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTC  784
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  957  GGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTC  1030

Query  785  CTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT  858
            |||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  CTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT  1104

Query  859  ATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCAC  932
            ||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..|
Sbjct 1105  ATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGC  1178

Query  933  CAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCC  1006
            |||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 1179  CAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCC  1252

Query 1007  AGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC  1080
            |||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  AGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC  1326

Query 1081  TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCC  1154
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||
Sbjct 1327  TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCC  1400

Query 1155  TGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCAT  1228
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCAT  1474

Query 1229  CTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAA  1302
            |.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1475  CAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAA  1548

Query 1303  GAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAG  1376
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1549  GAACAAGAAGCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAG  1622

Query 1377  TGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC  1407
            |||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1623  TGGTGATAATATAAGTCCACAAGACGGTAGC  1653