Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15394
• Subject: XM_011240433.2
• Aligned Length: 1663
• Identities: 1230
• Gaps: 311

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGG-----------------------------------------------------------------  305
            ||||||.||                                                                 
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  306  --------------------------------------------------------------------------  305
                                                                                      
Sbjct  445  CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA  518

Query  306  ---------------------------------------GGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG  340
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATG  592

Query  341  ATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGAGGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACC  414
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|.||||||||.||....||.|||||.||||||||.
Sbjct  593  ATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATAGCCAGCCGCTGGAGGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACG  666

Query  415  CCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT  488
            ||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGGCAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTT  740

Query  489  TGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCAT  562
            |||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.|
Sbjct  741  TGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGT  814

Query  563  CTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA  636
            |.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCA  888

Query  637  GGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCAT  710
            |||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||
Sbjct  889  GGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCAT  962

Query  711  GGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTC  784
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  GGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTC  1036

Query  785  CTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT  858
            |||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTT  1110

Query  859  ATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCAC  932
            ||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..|
Sbjct 1111  ATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGC  1184

Query  933  CAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCC  1006
            |||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 1185  CAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCC  1258

Query 1007  AGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC  1080
            |||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTAC  1332

Query 1081  TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCC  1154
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||
Sbjct 1333  TTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCC  1406

Query 1155  TGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCAT  1228
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCAT  1480

Query 1229  CTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAA  1302
            |.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481  CAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAA  1554

Query 1303  GAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAG-GCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCA  1375
            ||.||||||||       .||.| ||| |||||            ||.||   |.||                 
Sbjct 1555  GAACAAGAAGC-------AGAGC-CAGAGCCTC------------TCTAT---GCGA-----------------  1588

Query 1376  GTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC---  1407
                         ||.||.||||.||  ||..   
Sbjct 1589  -------------AAATCAACAGACC--TAAGAAA  1608