Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15394
• Subject: XM_011240434.2
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1272
• Gaps: 185

Alignment

Query    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA  74

Query   75  TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct   75  TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG  148

Query  149  ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC  222
            |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC  222

Query  223  GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA  296

Query  297  GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT----  333
            ||||||.||||   |||    .||||| ||    ||  |||             ||||||      ||.|    
Sbjct  297  GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC  370

Query  334  --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA  357
                          ||||               ||    |||.||       |.|||.||          |.||
Sbjct  371  GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA  444

Query  358  CCTGTAAGTAATGG-CT------AT-TCGTT-----------TGAG---------------GATTTTGAAGAA-  396
            |||||.| |..||| ||      || ||.||           ||||               ||.||.|||.|| 
Sbjct  445  CCTGTTA-TCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAA  517

Query  397  -----------------CGGTTT------GCTG-----CAG----CCACC--CCGAACAGA---AACCTGCCCA  433
                             |.||.|      ||||     |||    |||||  || ||.|||   ||..||    
Sbjct  518  AGGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGGTTCCCACCAGCC-AAAAGAAGGAAGGTG----  586

Query  434  CAGACTTTGATGAGATTTTTG------AGGCAAC---GAAG-GCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACAT  497
                  ||.||||    |.||      ||.||||   .||| ||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  587  ------TTTATGA----TGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACAT  650

Query  498  GTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTC  571
            ||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|
Sbjct  651  GTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCC  724

Query  572  AGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTT  645
            ||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  725  AGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTC  798

Query  646  GCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCA  719
            ||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||
Sbjct  799  GCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCA  872

Query  720  GCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTC  793
            ||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  873  GCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCC  946

Query  794  AGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTG  867
            ||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  947  AGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTA  1020

Query  868  CCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAG  941
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||..||||||||||
Sbjct 1021  GCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAG  1094

Query  942  TCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGC  1015
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1095  TCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCAC  1168

Query 1016  CCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAA  1089
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  CCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAA  1242

Query 1090  GTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1243  GTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTC  1316

Query 1164  TACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCC  1237
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1317  TACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCC  1390

Query 1238  ATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAA  1311
            |.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1391  ACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAA  1464

Query 1312  GCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAA  1385
            ||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1465  GCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTGATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAA  1538

Query 1386  TATAAGTCCACAGGCCGGTAGC  1407
            ||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1539  TATAAGTCCACAAGACGGTAGC  1560