Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15394
- Subject:
- XM_017319948.1
- Aligned Length:
- 1764
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 357
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGG----------------------------------------------------------------- 305
||||||.||
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 306 -------------------------------------------------------------------------- 305
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 306 -------------------------------------------------------------------------- 305
Sbjct 445 CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA 518
Query 306 -------------------------------------------------------------------------- 305
Sbjct 519 GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT 592
Query 306 ----------------------------------------------------------------------GGTT 309
||||
Sbjct 593 ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT 666
Query 310 CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATGGCTATTCGTTTGA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|..||.|.||
Sbjct 667 CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTTATGATGTGCCAAAAAGTCAACCTGTAAGTAATAGCCAGCCGCTGGA 740
Query 384 GGATTTTGAAGAACGGTTTGCTGCAGCCACCCCGAACAGAAACCTGCCCACAGACTTTGATGAGATTTTTGAGG 457
||||||.||....||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|..||||||||||||.||.|.||||
Sbjct 741 GGATTTCGACTCGCGCTTTGCCGCAGCCACGCCGAACAGGAACCTGTCAATGGACTTTGATGAGCTTCTCGAGG 814
Query 458 CAACGAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACT 531
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||
Sbjct 815 CAACCAAGGCTGTGACCCAATTAGAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACT 888
Query 532 CCTGCAACTCCAGGTGATGCCTTTATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTC 605
||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.||
Sbjct 889 CCTGCAACCCCAGGTGATGCCTTTCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTC 962
Query 606 TGTACCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTC 679
|.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 963 TATGTCTTTCGGCACTGCTGCTGTACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCC 1036
Query 680 AGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAGATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAG 753
||||||||||.||.|||||||||||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1037 AGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAGATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAG 1110
Query 754 CCCATCGCATGGGGCCAGCCGGGTCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCC 827
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CCCATCGCATGGGGCCAGCCAGGTCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCC 1184
Query 828 GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC 901
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCAGCCGCCTTCATGCCCACACAAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCC 1258
Query 902 TTGCCACCGTCCCAGGCACGAGTGACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGC 975
||||.||||||||||||||||.||||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259 TTGCAACCGTCCCAGGCACGAATGACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGG 1332
Query 976 AAAGAAACGTTTAAGGATTTCCAGATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCT 1049
||.||..||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCAGATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCT 1406
Query 1050 CACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG 1123
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GACCTGTACCTCAGAGGCCTTCTCCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATG 1480
Query 1124 ACTTTGACATCTCCCAGTTGAATTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCA 1197
||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACTTTGACATCTCCCAACTGAACTTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCA 1554
Query 1198 GCCCCTAGACAGAGCTCTCCATCCAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGA 1271
||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 1555 GCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATCCAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGA 1628
Query 1272 AGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAGGCCTCATCCAACAGTG 1345
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 1629 AGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCAAAAGTGAAGAACAAGAAGCACCTGATGGATCACAGGCCTCCTCCACCAGTG 1702
Query 1346 ATCCATTTGGTGAGCCCAGTGGGGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC 1407
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1703 ATCCATTTGGGGAGCCCAGTGGTGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAAGACGGTAGC 1764