Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15394
- Subject:
- XM_017319951.1
- Aligned Length:
- 1671
- Identities:
- 1219
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGAAAGAAAGGTCAGGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACTGAGACAGAACTTCAAGTAGCTGTGAAAACCAGCGCCAAGAAAGACTCCAGGAAGAAAGGTCAGGA 74
Query 75 TCGCAGTGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGTGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAATTGATCGGGATTG 148
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 TCGCAGCGAAGCCACTTTGATAAAGAGGTTTAAAGGCGAAGGGGTCCGGTACAAAGCCAAGCTGATTGGGATTG 148
Query 149 ATGAAGTTTCCGCAGCTCGGGGAGACATGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAACTCAAGGGCGTTGTTGCTGGC 222
|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 ATGAAGTGTCCGCAGCTCGGGGAGACAAGTTATGTCAAGATTCCATGATGAAGCTCAAGGGTGTTGTTGCTGGC 222
Query 223 GCTCGTTCCAAAGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCACGTTCCAAGGGAGAACACAAACAGAAAATCTTTTTAACCATCTCCTTTGGAGGAATCAAAATCTTTGATGA 296
Query 297 GAAGACAGGGG---TTC----CCACCA-GC----CA--AAA-------------GAAGGA------AGGT---- 333
||||||.|||| ||| .||||| || || ||| |||||| ||.|
Sbjct 297 GAAGACGGGGGCCCTTCAGCATCACCATGCTGTTCATGAAATTTCCTACATTGCGAAGGACATCACAGATCATC 370
Query 334 --------------GTTT---------------AT----GATGTG-------CCAAAAAG----------TCAA 357
|||| || |||.|| |.|||.|| |.||
Sbjct 371 GGGCTTTCGGATACGTTTGCGGGAAGGAAGGGAATCACAGATTTGTGGCCATCAAAACAGCCCAGGCGGCTGAA 444
Query 358 CCTGT-------------------------------------------AAGTAATG------------------ 370
||||| |||.||.|
Sbjct 445 CCTGTTATCCTGGACTTGAGAGATCTCTTTCAACTCATCTATGAGCTGAAGCAAAGAGAAGAATTGGAAAAAAA 518
Query 371 ----------------------------GCTAT--------TCGTTT-----GAGGATTTTGAAGAAC------ 397
|||.| .|.||| ||||||.|.|||||.|
Sbjct 519 GGCACAAAAGGATAAGCAGTGTGAACAAGCTGTGTACCAGACCATTTTGGAAGAGGATGTGGAAGATCCCGTGT 592
Query 398 ------------GGTTTGCTGC--------AGCCACCCCG---------AACAGAA------------------ 424
.|||||..|| |||||..||| |||||||
Sbjct 593 ACCAGTACATTGTGTTTGAGGCTGGACATGAGCCAATCCGTGATCCTGAAACAGAAGAGAACATTTACCAGGTT 666
Query 425 ---ACCTGCCCACAGA--------CTTTGATGAGATTTTTGAGGCAACGAAG-------GCTGTGACCCAATTA 480
|||.|||.|.||| .||| |||| ||.|.||| .||| |||||||||||||||
Sbjct 667 CCCACCAGCCAAAAGAAGGAAGGTGTTT-ATGA------TGTGCCAA-AAAGTCAACCTGCTGTGACCCAATTA 732
Query 481 GAACTTTTTGGGGACATGTCCACACCCCCTGATATAACCTCTCCTTCCACTCCTGCAACTCCAGGTGATGCCTT 554
|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 733 GAACTTTTTGGAGACATGTCCACCCCTCCTGATATAACCTCTCCCCCTACTCCTGCAACCCCAGGTGATGCCTT 806
Query 555 TATCCCATCTTCATCTCAGACCCTTCCAGCGAGTGCAGATGTGTTTAGTTCTGTACCTTTCGGCACTGCTGCTG 628
|.||||.||.||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||||||.|.|||.|..||||||||||||||||||
Sbjct 807 TCTCCCGTCGTCGTCCCAGACGCTTCCGGGGAGTGCAGATGTGTTTGGCTCTATGTCTTTCGGCACTGCTGCTG 880
Query 629 TACCCTCAGGTTACGTTGCAATGGGCGCTGTCCTCCCGTCCTTCTGGGGTCAGCAGCCCCTCGTCCAACAGCAG 702
|||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 881 TACCCTCAGGTTATGTCGCTATGGGCGCCGTCCTCCCATCCTTCTGGGGCCAGCAGCCCCTTGTTCAACAGCAG 954
Query 703 ATGGTCATGGGTGCCCAGCCACCAGTCGCTCAGGTGATGCCGGGGGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCGGG 776
||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 955 ATCGCCATGGGTGCTCAGCCACCCGTCGCTCAGGTGATACCAGGAGCTCAGCCCATCGCATGGGGCCAGCCAGG 1028
Query 777 TCTCTTTCCTGCCACTCAGCAGCCCTGGCCAACTGTGGCCGGGCAGTTTCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACAC 850
|||||||||||||||.|||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 TCTCTTTCCTGCCACCCAGCAAGCCTGGCCCACTGTGGCCGGGCAGTTCCCGCCAGCCGCCTTCATGCCCACAC 1102
Query 851 AAACTGTTATGCCTTTGCCAGCTGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCCACCGTCCCAGGCACGAGT 924
||||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1103 AAACTGTTATGCCTTTAGCAGCCGCCATGTTCCAAGGTCCCCTCACCCCCCTTGCAACCGTCCCAGGCACGAAT 1176
Query 925 GACTCCACCAGGTCAAGTCCACAGACCGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGCAAAGAAACGTTTAAGGATTTCCA 998
|||||..||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||||||||||
Sbjct 1177 GACTCTGCCAGGTCAAGTCCACAGAGTGACAAGCCCAGGCAGAAAATGGGGAAGGAGTCGTTCAAGGATTTCCA 1250
Query 999 GATGGCCCAGCCTCCGCCCGTGCCCTCCCGCAAACCCGACCAGCCCTCCCTCACCTGTACCTCAGAGGCCTTCT 1072
|||||.|||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GATGGTCCAGCCTCCACCCGTACCCTCCCGGAAGCCTGACCAGCCCTCCCTGACCTGTACCTCAGAGGCCTTCT 1324
Query 1073 CCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAGTTGAAT 1146
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.
Sbjct 1325 CCAGTTACTTCAACAAAGTCGGGGTGGCACAGGATACAGACGACTGTGATGACTTTGACATCTCCCAACTGAAC 1398
Query 1147 TTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCGACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGACAGAGCTCTCCATC 1220
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1399 TTGACCCCTGTGACTTCTACCACACCATCTACCAACTCACCTCCAACCCCAGCCCCTAGGCAGAGCTCTCCATC 1472
Query 1221 CAAATCATCTGCATCCCATGCCAGTGATCCTACCACAGATGACATCTTTGAAGAGGGCTTTGAAAGTCCCAGCA 1294
|||||||||.||||||||.|.||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473 CAAATCATCAGCATCCCACGTCAGTGACCCGACCGCAGATGACATCTTCGAAGAAGGCTTTGAAAGTCCCAGCA 1546
Query 1295 AAAGCGAAGAGCAAGAAGCTCCTGATGGATCACAG-GCCTCATCCAACAGTGATCCATTTGGTGAGCCCAGTGG 1367
||||.|||||.|||||||| .||.| ||| ||||| ||.|| |.||
Sbjct 1547 AAAGTGAAGAACAAGAAGC-------AGAGC-CAGAGCCTC------------TCTAT---GCGA--------- 1588
Query 1368 GGAGCCCAGTGGTGATAATATAAGTCCACAGGCCGGTAGC--- 1407
||.||.||||.|| ||..
Sbjct 1589 ---------------------AAATCAACAGACC--TAAGAAA 1608