Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15425
- Subject:
- XM_006497355.3
- Aligned Length:
- 1329
- Identities:
- 1192
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGACGGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCACCACCCCGCCGTGCTCAACGGGCAGCACCCGGA 74
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGAGGTGACTGCGGACCAGCCGCGCTGGGTGAGCCACCATCACCCCGCGGTCCTCAACGGTCAGCACCCAGA 74
Query 75 CACGCACCACCCGGGCCTCAGCCACTCCTACATGGACGCGGCGCAGTACCCGCTGCCGGAGGAGGTGGATGTGC 148
|||||||||||||||||||.||||.||.|||||||| .||.|||||.||||||.||||.||||||||.||.|
Sbjct 75 CACGCACCACCCGGGCCTCGGCCATTCGTACATGGA---AGCTCAGTATCCGCTGACGGAAGAGGTGGACGTAC 145
Query 149 TTTTTAACATCGACGGTCAAGGCAACCACGTCCCGCCCTACTACGGAAACTCGGTCAGGGCCACGGTGCAGAGG 222
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 146 TTTTTAACATCGATGGTCAAGGCAACCACGTCCCGTCCTACTACGGAAACTCCGTCAGGGCTACGGTGCAGAGG 219
Query 223 TACCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTGTGCCGCCCGCCTCTGCTTCATGGATCCCTACCCTGGCTGGACGG 296
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 220 TATCCTCCGACCCACCACGGGAGCCAGGTATGCCGCCCGCCTCTGCTGCACGGATCTCTGCCCTGGCTGGATGG 293
Query 297 CGGCAAAGCCCTGGGCAGCCACCACACCGCCTCCCCCTGGAATCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 370
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CGGCAAAGCCCTGAGCAGCCACCACACCGCCTCGCCCTGGAACCTCAGCCCCTTCTCCAAGACGTCCATCCACC 367
Query 371 ACGGCTCCCCGGGGCCCCTCTCCGTCTACCCCCCGGCCTCGTCCTCCTCCTTGTCGGGGGGCCACGCCAGCCCG 444
|||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||..||.|||..||||||.||||.||.
Sbjct 368 ACGGCTCTCCGGGGCCTCTGTCCGTTTACCCTCCGGCTTCATCCTCTTCTCTGGCGGCCGGCCACTCCAGTCCT 441
Query 445 CACCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAGGACGTCTCCCCGGACCCATCGCTGTCCACCCCAGGCTCGGC 518
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 442 CATCTCTTCACCTTCCCGCCCACCCCGCCGAAAGACGTCTCCCCAGACCCGTCGCTGTCCACCCCGGGATCCGC 515
Query 519 CGGCTCGGCCCGGCAGGACGAGAAAGAGTGCCTCAAGTACCAGGTGCCCCTGCCCGACAGCATGAAGCTGGAGT 592
|||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||.
Sbjct 516 CGGGTCGGCCAGGCAAGATGAGAAAGAGTGCCTCAAGTATCAGGTGCAGCTGCCAGATAGCATGAAGCTGGAGA 589
Query 593 CGTCCCACTCCCGTGGCAGCATGACCGCCCTGGGTGGAGCCTCCTCGTCGACCCACCACCCCATCACCACCTAC 666
||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 590 CGTCTCACTCTCGAGGCAGCATGACCACCCTGGGTGGGGCCTCATCCTCAGCCCACCACCCCATTACCACCTAT 663
Query 667 CCGCCCTACGTGCCCGAGTACAGCTCCGGACTCTTCCCCCCCAGCAGCCTGCTGGGCGGCTCCCCCACCGGCTT 740
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 664 CCGCCCTATGTGCCCGAGTACAGCTCTGGACTCTTCCCACCCAGCAGCCTGCTGGGAGGATCCCCTACCGGGTT 737
Query 741 CGGATGCAAGTCCAGGCCCAAGGCCCGGTCCAGCACAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGTGGGGCAACCTCGACCC 814
||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 738 CGGATGTAAGTCGAGGCCCAAGGCACGATCCAGCACAGGCAGGGAGTGTGTGAACTGCGGGGCAACCTCTACCC 811
Query 815 CACTGTGGCGGCGAGATGGCACGGGACACTACCTGTGCAACGCCTGCGGGCTCTATCACAAAATGAACGGACAG 888
|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 812 CACTGTGGCGGCGAGATGGTACCGGGCACTACCTTTGCAATGCCTGCGGACTCTACCATAAAATGAATGGGCAG 885
Query 889 AACCGGCCCCTCATTAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCTGCAGCCAGGAGAGCAGGGACGTCCTGTGCGAACTGTCA 962
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 886 AACCGGCCCCTTATCAAGCCCAAGCGAAGGCTGTCGGCAGCAAGGAGAGCAGGGACATCCTGCGCGAACTGTCA 959
Query 963 GACCACCACAACCACACTCTGGAGGAGGAATGCCAATGGGGACCCTGTCTGCAATGCCTGTGGGCTCTACTACA 1036
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 960 GACCACCACCACCACCCTCTGGAGGAGGAACGCTAATGGGGACCCGGTCTGCAATGCCTGTGGGCTGTACTACA 1033
Query 1037 AGCTTCACAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAGGAAGGCATCCAGACCAGAAACCGAAAAATGTCTAGC 1110
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||
Sbjct 1034 AGCTTCATAATATTAACAGACCCCTGACTATGAAGAAAGAAGGCATCCAGACCCGAAACCGGAAGATGTCTAGC 1107
Query 1111 AAATCCAAAAAGTGCAAAAAAGTGCATGACTCACTGGAGGACTTCCCCAAGAACAGCTCGTTTAACCCGGCCGC 1184
|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1108 AAATCGAAAAAGTGCAAAAAGGTGCATGACGCGCTGGAGGACTTCCCCAAGAGCAGCTCCTTCAACCCGGCCGC 1181
Query 1185 CCTCTCCAGACACATGTCCTCCCTGAGCCACATCTCGCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACGCCCA 1258
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1182 TCTCTCCAGACACATGTCATCCCTGAGCCACATCTCTCCCTTCAGCCACTCCAGCCACATGCTGACCACACCGA 1255
Query 1259 CGCCGATGCACCCGCCATCCAGCCTGTCCTTTGGACCACACCACCCCTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1329
||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 CGCCCATGCATCCGCCCTCCGGCCTCTCCTTCGGACCTCACCACCCTTCCAGCATGGTCACCGCCATGGGT 1326