Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15430
• Subject: NM_001282618.2
• Aligned Length: 1065
• Identities: 822
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACCGTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGCCGAGCGCTCTAAGATGATCGACAAGAACCTGCGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACGGAGAGAAGGCGGCGCGGGAGGTGAAGTTGCTGCTGTTGGGTGCTGGGGAGTCAGGGAAGAGCACCATCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCAAGCAGATGAAGATCATCCACGAGGATGGCTACTCCGAGGAGGAATGCCGGCAGTACCGGGCGGTTGTCTAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGCAACACCATCCAGTCCATCATGGCCATTGTCAAAGCCATGGGCAACCTGCAGATCGACTTTGCCGACCCCTC  296
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGGCCATTGTCAAAGCCATGGGCAACCTGCAGATCGACTTTGCCGACCCCTC  53

Query  297  CAGAGCGGACGACGCCAGGCAGCTATTTGCACTGTCCTGCACCGCCGAGGAGCAAGGCGTGCTCCCTGATGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  CAGAGCGGACGACGCCAGGCAGCTATTTGCACTGTCCTGCACCGCCGAGGAGCAAGGCGTGCTCCCTGATGACC  127

Query  371  TGTCCGGCGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCATGGTGTGCAGGCCTGCTTTGGCCGCTCAAGGGAATACCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  TGTCCGGCGTCATCCGGAGGCTCTGGGCTGACCATGGTGTGCAGGCCTGCTTTGGCCGCTCAAGGGAATACCAG  201

Query  445  CTCAACGACTCAGCTGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGTATTGCACAGAGTGACTACATCCCCACACAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CTCAACGACTCAGCTGCCTACTACCTGAACGACCTGGAGCGTATTGCACAGAGTGACTACATCCCCACACAGCA  275

Query  519  AGATGTGCTACGGACCCGCGTAAAGACCACGGGGATCGTGGAGACACACTTCACCTTCAAGGACCTACACTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  AGATGTGCTACGGACCCGCGTAAAGACCACGGGGATCGTGGAGACACACTTCACCTTCAAGGACCTACACTTCA  349

Query  593  AGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTTTGAGGGCGTCACAGCCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  AGATGTTTGATGTGGGTGGTCAGCGGTCTGAGCGGAAGAAGTGGATCCACTGCTTTGAGGGCGTCACAGCCATC  423

Query  667  ATCTTCTGCGTAGCCTTGAGCGCCTATGACTTGGTGCTAGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGCATGCATGAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  ATCTTCTGCGTAGCCTTGAGCGCCTATGACTTGGTGCTAGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGCATGCATGAGAG  497

Query  741  CATGAAGCTATTCGATAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACGTCCATCATCCTCTTCCTCAACAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CATGAAGCTATTCGATAGCATCTGCAACAACAAGTGGTTCACAGACACGTCCATCATCCTCTTCCTCAACAAGA  571

Query  815  AGGACCTGTTTGAGGAGAAGATCACACACAGTCCCCTGACCATCTGCTTCCCTGAGTACACAGGGGCCAACAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  AGGACCTGTTTGAGGAGAAGATCACACACAGTCCCCTGACCATCTGCTTCCCTGAGTACACAGGGGCCAACAAA  645

Query  889  TATGATGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGTAAGTTTGAGGACCTGAATAAGCGCAAAGACACCAAGGAGATCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  TATGATGAGGCAGCCAGCTACATCCAGAGTAAGTTTGAGGACCTGAATAAGCGCAAAGACACCAAGGAGATCTA  719

Query  963  CACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTCGTGTTTGACGCCGTCACCGATGTCATCATCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CACGCACTTCACGTGCGCCACCGACACCAAGAACGTGCAGTTCGTGTTTGACGCCGTCACCGATGTCATCATCA  793

Query 1037  AGAACAACCTGAAGGACTGCGGCCTCTTC  1065
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  AGAACAACCTGAAGGACTGCGGCCTCTTC  822