Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15439
- Subject:
- NM_002103.5
- Aligned Length:
- 2211
- Identities:
- 2019
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGACTGGGAGGATGAATTCGACCTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTTTAAACCGCACTTTGTCCATGTCCTCACTGCCAGGACTGGAGGACTGGGAGGATGAATTCGACCTGGA 74
Query 75 GAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCTGGGAGGTGGCTAACAAGGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTGCAGACGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAACGCAGTGCTCTTCGAAGTGGCCTGGGAGGTGGCTAACAAGGTGGGTGGCATCTACACGGTGCTGCAGACGA 148
Query 149 AGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCTGGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGCGAAGGTGACAGGGGACGAATGGGGCGACAACTACTTCCTGGTGGGGCCGTACACGGAGCAGGGCGTGAGG 222
Query 223 ACCCAGGTGGAACTGCTGGAGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAGGGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCCAGGTGGAACTGCTGGAGGCCCCCACCCCGGCCCTGAAGAGGACACTGGATTCCATGAACAGCAAGGGCTG 296
Query 297 CA------------------------------------------------------------------------ 298
||
Sbjct 297 CAAGGTGTATTTCGGGCGCTGGCTGATCGAGGGAGGCCCTCTGGTGGTGCTCCTGGACGTGGGTGCCTCAGCTT 370
Query 299 -------------------------------------------------------------------------- 298
Sbjct 371 GGGCCCTGGAGCGCTGGAAGGGAGAGCTCTGGGATACCTGCAACATCGGAGTGCCGTGGTACGACCGCGAGGCC 444
Query 299 ----------------------------------------------AGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCC 326
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACGACGCTGTCCTCTTTGGCTTTCTGACCACCTGGTTCCTGGGTGAGTTCCTGGCACAGAGTGAGGAGAAGCC 518
Query 327 ACATGTGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGTCGTGCCCGGCGACTGCCTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACATGTGGTTGCTCACTTCCATGAGTGGTTGGCAGGCGTTGGACTCTGCCTGTGTCGTGCCCGGCGACTGCCTG 592
Query 401 TAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAAC 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGCAACCATCTTCACCACCCATGCCACGCTGCTGGGGCGCTACCTGTGTGCCGGTGCCGTGGACTTCTACAAC 666
Query 475 AACCTGGAGAACTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATCTACCACCGATACTGCATGGAAAGGGC 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACCTGGAGAACTTCAACGTGGACAAGGAAGCAGGGGAGAGGCAGATCTACCACCGATACTGCATGGAAAGGGC 740
Query 549 GGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTTCACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCAGCCCACTGCGCTCACGTCTTCACTACTGTGTCCCAGATCACCGCCATCGAGGCACAGCACTTGCTCAAGA 814
Query 623 GGAAACCAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAGAAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTC 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGAAACCAGATATTGTGACCCCCAATGGGCTGAATGTGAAGAAGTTTTCTGCCATGCATGAGTTCCAGAACCTC 888
Query 697 CATGCTCAGAGCAAGGCTCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGCATCTGGACTTCAACTTGGA 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATGCTCAGAGCAAGGCTCGAATCCAGGAGTTTGTGCGGGGCCATTTTTATGGGCATCTGGACTTCAACTTGGA 962
Query 771 CAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTATGAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCAT 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGACCTTATACTTCTTTATCGCCGGCCGCTATGAGTTCTCCAACAAGGGTGCTGACGTCTTCCTGGAGGCAT 1036
Query 845 TGGCTCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGGTTGCCTTCTTCATCATGCCAGCG 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGCTCGGCTCAACTATCTGCTCAGAGTGAACGGCAGCGAGCAGACAGTGGTTGCCTTCTTCATCATGCCAGCG 1110
Query 919 CGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACCCTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGGACACGGCCAACAC 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGGACCAACAATTTCAACGTGGAAACCCTCAAAGGCCAAGCTGTGCGCAAACAGCTTTGGGACACGGCCAACAC 1184
Query 993 GGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGGTTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGC 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGTGAAGGAAAAGTTCGGGAGGAAGCTTTATGAATCCTTACTGGTTGGGAGCCTTCCCGACATGAACAAGATGC 1258
Query 1067 TGGATAAGGAAGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGCGGCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGATAAGGAAGACTTCACTATGATGAAGAGAGCCATCTTTGCAACGCAGCGGCAGTCTTTCCCCCCTGTGTGC 1332
Query 1141 ACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAGACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAG 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCCACAATATGCTGGATGACTCCTCAGACCCCATCCTGACCACCATCCGCCGAATCGGCCTCTTCAATAGCAG 1406
Query 1215 TGCCGACAGGGTGAAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTCCACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATG 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGCCGACAGGGTGAAGGTGATTTTCCACCCGGAGTTCCTCTCCTCCACAAGCCCCCTGCTCCCTGTGGACTATG 1480
Query 1289 AGGAGTTTGTCCGTGGCTGTCACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGCTGAG 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAGTTTGTCCGTGGCTGTCACCTTGGAGTCTTCCCCTCCTACTATGAGCCTTGGGGCTACACACCGGCTGAG 1554
Query 1363 TGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCTCTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGC 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCACGGTTATGGGAATCCCCAGTATCTCCACCAATCTCTCCGGCTTCGGCTGCTTCATGGAGGAACACATCGC 1628
Query 1437 AGACCCCTCAGCTTACGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCCTGCTCGCAGCTCA 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGACCCCTCAGCTTACGGTATCTACATTCTTGACCGGCGGTTCCGCAGCCTGGATGATTCCTGCTCGCAGCTCA 1702
Query 1511 CCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAGCCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTC 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTCCTTCCTCTACAGTTTCTGTCAGCAGAGCCGGCGGCAGCGTATCATCCAGCGGAACCGCACGGAGCGCCTC 1776
Query 1585 TCCGACCTTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGTACTATATGTCTGCGCGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTT 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCCGACCTTCTGGACTGGAAATACCTAGGCCGGTACTATATGTCTGCGCGCCACATGGCGCTGTCCAAGGCCTT 1850
Query 1659 TCCAGAGCACTTCACCTACGAGCCCAACGAGGCGGATGCGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGCCAGCCTCGG 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TCCAGAGCACTTCACCTACGAGCCCAACGAGGCGGATGCGGCCCAGGGGTACCGCTACCCACGGCCAGCCTCGG 1924
Query 1733 TGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCACCAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGG 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGCCACCGTCGCCCTCGCTGTCACGACACTCCAGCCCGCACCAGAGTGAGGACGAGGAGGATCCCCGGAACGGG 1998
Query 1807 CCGCTGGAGGAAGACGGCGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCCGTGCACC 1880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCGCTGGAGGAAGACGGCGAGCGCTACGATGAGGACGAGGAGGCCGCCAAGGACCGGCGCAACATCCGTGCACC 2072
Query 1881 AGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGCAGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCT 1954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAGTGGCCGCGCCGAGCGTCCTGCACCTCCTCCACCAGCGGCAGCAAGCGCAACTCTGTGGACACGGCCACCT 2146
Query 1955 CCAGCTCACTCAGCACCCCGAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC 2019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCAGCTCACTCAGCACCCCGAGCGAGCCCCTCAGCCCCACCAGCTCCCTGGGCGAGGAGCGTAAC 2211