Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15451
• Subject: NM_031370.3
• Aligned Length: 1065
• Identities: 918
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGTCGGAGGAGCAGTTCGGCGGGGACGGGGCGGCGGCAGCGGCAACGGCGGCGGTAGGCGGCTCGGCGGGCGA  74
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Sbjct    1  ATGTCGGAGGAGCAGTTCGGCGGGGACGGGGCGGCGGCAGCGGCAACGGCGGCGGTAGGCGGCTCGGCGGGCGA  74

Query   75  GCAGGAGGGAGCCATGGTGGCGGCGACACAGGGGGCAGCGGCGGCGGCGGGAAGCGGAGCCGGGACCGGGGGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGAGGGAGCCATGGTGGCGGCGACACAGGGGGCAGCGGCGGCGGCGGGAAGCGGAGCCGGGACCGGGGGCG  148

Query  149  GAACCGCGTCTGGAGGCACCGAAGGGGGCAGCGCCGAGTCGGAGGGGGCGAAGATTGACGCCAGTAAGAACGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAACCGCGTCTGGAGGCACCGAAGGGGGCAGCGCCGAGTCGGAGGGGGCGAAGATTGACGCCAGTAAGAACGAG  222

Query  223  GAGGATGAAGGCCATTCAAACTCCTCCCCACGACACTCTGAAGCAGCGACGGCACAGCGGGAAGAATGGAAAAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGATGAAGGCCATTCAAACTCCTCCCCACGACACTCTGAAGCAGCGACGGCACAGCGGGAAGAATGGAAAAT  296

Query  297  GTTTATAGGAGGCCTTAGCTGGGACACTACAAAGAAAGATCTGAAGGACTACTTTTCCAAATTTGGTGAAGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTATAGGAGGCCTTAGCTGGGACACTACAAAGAAAGATCTGAAGGACTACTTTTCCAAATTTGGTGAAGTTG  370

Query  371  TAGACTGCACTCTGAAGTTAGATCCTATCACAGGGCGATCAAGGGGTTTTGGCTTTGTGCTATTTAAAGAATCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGACTGCACTCTGAAGTTAGATCCTATCACAGGGCGATCAAGGGGTTTTGGCTTTGTGCTATTTAAAGAATCG  444

Query  445  GAGAGTGTAGATAAGGTCATGGATCAAAAAGAACATAAATTGAATGGGAAGGTGATTGATCCTAAAAGGGCCAA  518
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Sbjct  445  GAGAGTGTAGATAAGGTCATGGATCAAAAAGAACATAAATTGAATGGGAAGGTGATTGATCCTAAAAGGGCCAA  518

Query  519  AGCCATGAAAACAAAAGAGCCGGTTAAAAAAATTTTTGTTGGTGGCCTTTCTCCAGATACACCTGAAGAGAAAA  592
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Sbjct  519  AGCCATGAAAACAAAAGAGCCGGTTAAAAAAATTTTTGTTGGTGGCCTTTCTCCAGATACACCTGAAGAGAAAA  592

Query  593  TAAGGGAGTACTTTGGTGGTTTTGGTGAGGTGGAATCCATAGAGCTCCCCATGGACAACAAGACCAATAAGAGG  666
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Sbjct  593  TAAGGGAGTACTTTGGTGGTTTTGGTGAGGTGGAATCCATAGAGCTCCCCATGGACAACAAGACCAATAAGAGG  666

Query  667  CGTGGGTTCTGCTTTATTACCTTTAAGGAAGAAGAACCAGTGAAGAAGATAATGGAAAAGAAATACCACAATGT  740
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Sbjct  667  CGTGGGTTCTGCTTTATTACCTTTAAGGAAGAAGAACCAGTGAAGAAGATAATGGAAAAGAAATACCACAATGT  740

Query  741  TGGTCTTAGTAAATGTGAAATAAAAGTAGCCATGTCGAAGGAACAATATCAGCAACAGCAACAGTGGGGATCTA  814
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Sbjct  741  TGGTCTTAGTAAATGTGAAATAAAAGTAGCCATGTCGAAGGAACAATATCAGCAACAGCAACAGTGGGGATCTA  814

Query  815  GAGGAGGATTTGCAGGAAGAGCTCGTGGAAGAGGTGGTG-----------------------------------  853
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Sbjct  815  GAGGAGGATTTGCAGGAAGAGCTCGTGGAAGAGGTGGTGGCCCCAGTCAAAACTGGAACCAGGGATATAGTAAC  888

Query  854  --------------------------------------------------------------------------  853
                                                                                      
Sbjct  889  TATTGGAATCAAGGCTATGGCAACTATGGATATAACAGCCAAGGTTACGGTGGTTATGGAGGATATGACTACAC  962

Query  854  --------------------------------------ACCAGCAGAGTGGTTATGGGAAGGTATCCAGGCGAG  889
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTTACAACAACTACTATGGATATGGTGATTATAGCAACCAGCAGAGTGGTTATGGGAAGGTATCCAGGCGAG  1036

Query  890  GTGGTCATCAAAATAGCTACAAACCATAC  918
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Sbjct 1037  GTGGTCATCAAAATAGCTACAAACCATAC  1065