Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15456
• Subject: NM_010480.5
• Aligned Length: 2199
• Identities: 1730
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCTGAGGAAACCCAGACCCAAGACCAACCAATGGAGGAGGAGGAGGTCGAGACCTTTGCCTTTCAGGCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AATTGCCCAGTTAATGTCCTTGATCATCAATACCTTCTACTCGAACAAAGAGATCTTTCTGAGGGAGCTCATCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCAATTCATCGGACGCTCTGGATAAAATCCGTTACGAGAGCCTGACGGACCCCAGTAAACTGGACTCGGGGAAG  222

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGAC  5
                                                                                 |||||
Sbjct  223  GAGCTGCACATCAATCTCATTCCCAGCAAACAGGACCGAACCCTGACCATTGTGGATACCGGGATTGGAATGAC  296

Query    6  CAAGGCTGACTTGATCAATAACCTTGGTACTATCGCCAAGTCTGGGACCAAAGCGTTCATGGAAGCTTTGCAGG  79
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CAAGGCCGACTTGATCAATAACCTTGGCACCATTGCCAAGTCGGGCACCAAAGCCTTCATGGAGGCTTTGCAGG  370

Query   80  CTGGTGCAGATATCTCTATGATTGGCCAGTTCGGTGTTGGTTTTTATTCTGCTTATTTGGTTGCTGAGAAAGTA  153
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CTGGTGCAGATATCTCTATGATTGGCCAGTTTGGTGTTGGTTTTTACTCTGCCTATTTGGTTGCTGAGAAAGTG  444

Query  154  ACTGTGATCACCAAACATAACGATGATGAGCAGTACGCTTGGGAGTCCTCAGCAGGGGGATCATTCACAGTGAG  227
            |||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  ACTGTCATCACGAAGCATAACGACGATGAGCAGTATGCCTGGGAGTCCTCAGCTGGGGGATCCTTCACAGTGAG  518

Query  228  GACAGACACAGGTGAACCTATGGGTCGTGGAACAAAAGTTATCCTACACCTGAAAGAAGACCAAACTGAGTACT  301
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  GACTGACACAGGTGAACCAATGGGTCGTGGAACAAAGGTTATCTTGCATCTGAAAGAAGACCAAACAGAGTATT  592

Query  302  TGGAGGAACGAAGAATAAAGGAGATTGTGAAGAAACATTCTCAGTTTATTGGATATCCCATTACTCTTTTTGTG  375
            ||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  TGGAGGAAAGGAGAATAAAGGAGATCGTGAAGAAGCATTCTCAGTTCATTGGCTATCCCATTACTCTCTTTGTG  666

Query  376  GAGAAGGAACGTGATAAAGAAGTAAGCGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGACAAAGAAGAAGAAAAAGAAAA  449
            |||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  667  GAGAAGGAACGAGATAAGGAAGTCAGTGATGATGAGGCTGAAGAAAAGGAAGAGAAAGAGGAAGAGAAAGAAAA  740

Query  450  AGAAGAGAAAGAGTCGGAAGACAAACCTGAAATTGAAGATGTTGGTTCTGATGAGGAA---GAAGAAAAGAAGG  520
            ||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||   ||.||.|||||||
Sbjct  741  AGAAGAAAAGGAGTCTGATGATAAACCTGAAATAGAAGATGTTGGCTCTGATGAAGAAGAGGAGGAGAAGAAGG  814

Query  521  ATGGTGACAAGAAGAAGAAGAAGAAGATTAAGGAAAAGTACATCGATCAAGAAGAGCTCAACAAAACAAAGCCC  594
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  ATGGTGACAAGAAGAAAAAGAAGAAGATAAAGGAAAAGTACATTGATCAAGAAGAACTCAACAAAACAAAGCCG  888

Query  595  ATCTGGACCAGAAATCCCGACGATATTACTAATGAGGAGTACGGAGAATTCTATAAGAGCTTGACCAATGACTG  668
            ||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct  889  ATTTGGACGAGAAATCCTGATGACATCACTAATGAGGAATATGGAGAGTTCTACAAGAGCTTAACTAACGATTG  962

Query  669  GGAAGATCACTTGGCAGTGAAGCATTTTTCAGTTGAAGGACAGTTGGAATTCAGAGCCCTTCTATTTGTCCCAC  742
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||.
Sbjct  963  GGAAGAACACTTGGCAGTAAAGCATTTTTCTGTTGAAGGACAATTAGAATTCCGGGCCCTTCTTTTTGTCCCAA  1036

Query  743  GACGTGCTCCTTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAATATCAAATTGTATGTACGCAGAGTTTTC  816
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  GACGCGCTCCTTTTGATCTGTTTGAAAACAGAAAGAAAAAGAACAACATCAAGTTGTATGTTCGCAGAGTTTTT  1110

Query  817  ATCATGGATAACTGTGAGGAGCTAATCCCTGAATATCTGAACTTCATTAGAGGGGTGGTAGACTCGGAGGATCT  890
            ||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111  ATCATGGATAACTGTGAGGAATTAATCCCTGAGTATCTGAATTTCATTAGAGGGGTAGTGGATTCTGAGGATCT  1184

Query  891  CCCTCTAAACATATCCCGTGAGATGTTGCAACAAAGCAAAATTTTGAAAGTTATCAGGAAGAATTTGGTCAAAA  964
            |||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCCTCTAAATATTTCCCGTGAAATGCTGCAACAAAGTAAAATTCTGAAAGTTATCAGAAAGAATTTGGTCAAGA  1258

Query  965  AATGCTTAGAACTCTTTACTGAACTGGCGGAAGATAAAGAGAACTACAAGAAATTCTATGAGCAGTTCTCTAAA  1038
            |||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  AATGCTTAGAACTATTTACTGAACTAGCAGAAGATAAAGAGAACTACAAAAAGTTTTATGAGCAGTTCTCAAAA  1332

Query 1039  AACATAAAGCTTGGAATACACGAAGACTCTCAAAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTAAGGTACTACACATC  1112
            ||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1333  AATATAAAGCTTGGAATTCACGAGGACTCTCAGAATCGGAAGAAGCTTTCAGAGCTGTTGCGGTACTACACATC  1406

Query 1113  TGCCTCTGGTGATGAGATGGTTTCTCTCAAGGACTACTGCACCAGAATGAAGGAGAACCAGAAACATATCTATT  1186
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1407  TGCTTCTGGGGACGAGATGGTTTCTCTGAAGGACTACTGTACCAGAATGAAGGAAAACCAGAAGCACATCTATT  1480

Query 1187  ATATCACAGGTGAGACCAAGGACCAGGTAGCTAACTCAGCCTTTGTGGAACGTCTTCGGAAACATGGCTTAGAA  1260
            .|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1481  TTATCACAGGTGAGACCAAGGACCAGGTTGCTAACTCCGCCTTTGTGGAACGTCTCCGAAAGCATGGCTTAGAA  1554

Query 1261  GTGATCTATATGATTGAGCCCATTGATGAGTACTGTGTCCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGGAAGACTTTAGT  1334
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1555  GTAATTTATATGATTGAGCCCATTGATGAGTATTGTGTGCAACAGCTGAAGGAATTTGAGGGCAAGACCTTGGT  1628

Query 1335  GTCAGTCACCAAAGAAGGCCTGGAACTTCCAGAGGATGAAGAAGAGAAAAAGAAGCAGGAAGAGAAAAAAACAA  1408
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GTCTGTTACCAAAGAAGGACTGGAACTTCCAGAAGATGAAGAGGAAAAGAAGAAACAGGAAGAGAAAAAGACAA  1702

Query 1409  AGTTTGAGAACCTCTGCAAAATCATGAAAGACATATTGGAGAAAAAAGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGA  1482
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AATTTGAGAACCTCTGCAAAATTATGAAAGATATTTTGGAGAAGAAGGTTGAAAAGGTGGTTGTGTCAAACCGA  1776

Query 1483  TTGGTGACATCTCCATGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGCTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGC  1556
            .||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGTGACATCCCCGTGCTGTATTGTCACAAGCACATATGGGTGGACAGCAAACATGGAGAGAATCATGAAAGC  1850

Query 1557  TCAAGCCCTAAGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAACCCTGACCATT  1630
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1851  TCAAGCCCTCAGAGACAACTCAACAATGGGTTACATGGCAGCAAAGAAACACCTGGAGATAAATCCTGATCACT  1924

Query 1631  CCATTATTGAGACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGATAAGAACGACAAGTCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTG  1704
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCATTATTGAAACCTTAAGGCAAAAGGCAGAGGCTGACAAGAATGACAAATCTGTGAAGGATCTGGTCATCTTG  1998

Query 1705  CTTTATGAAACTGCGCTCCTGTCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACACATGCTAACAGGATCTACAG  1778
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTGTATGAAACTGCACTCCTATCTTCTGGCTTCAGTCTGGAAGATCCCCAGACCCATGCTAACAGGATCTACAG  2072

Query 1779  GATGATCAAACTTGGTCTGGGTATTGATGAAGATGACCCTACTGCTGATGATACCAGTGCTGCTGTAACTGAAG  1852
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GATGATCAAGCTTGGTCTAGGTATTGATGAGGATGATCCTACTGTGGATGACACCAGTGCTGCTGTAACTGAAG  2146

Query 1853  AAATGCCACCCCTTGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  1905
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAATGCCTCCCCTGGAAGGAGATGACGACACATCACGCATGGAAGAAGTAGAC  2199