Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15520
• Subject: NM_001173456.1
• Aligned Length: 1181
• Identities: 904
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ---------ATGCTGGCCGCCTTCATCTCCCGCGTGTTG--AGGCGAGTTGCCCAGAAATCAGCTCGCAGAGTG  63
                     |||||.|||||   |.|||||||||||.||  .|||  |.|.|.|||||..|.||..||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAAGATGCTCGCCGC---CGTCTCCCGCGTGCTGTCTGGC--GCTTCTCAGAAGCCGGCAAGCAGAGTG  69

Query   64  CTGGTGGCATCCCGTAACTCCTCAAATGACGCTACATTTGAAATTAAGAAATGTGATCTTTATCTGTTGGAAGA  137
            |||||.|||||||||||.|...|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|.|.|||||||
Sbjct   70  CTGGTAGCATCCCGTAATTTTGCAAATGATGCTACATTTGAAATTAAGAAATGTGACCTTCACCGGCTGGAAGA  143

Query  138  GGGTCCCCCTGTCACTACAGTGCTCACTAGGGCGGAGGGGCTTAAATACTACAGGATGATGCTGACTGTTCGCC  211
            .||.||.||||||||.|||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  144  AGGCCCTCCTGTCACAACAGTGCTCACCAGGGAGGATGGGCTCAAATACTACAGGATGATGCAGACTGTACGCC  217

Query  212  GCATGGAATTGAAGGCAGATCAGCTGTACAAACAGAAATTCATTCGCGGTTTCTGTCACCTGTGCGATGGTCAG  285
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  218  GAATGGAGTTGAAAGCAGATCAGCTGTATAAACAGAAAATTATTCGTGGTTTCTGTCACTTGTGTGATGGTCAG  291

Query  286  GAAGCTTGTTGCGTGGGCCTTGAGGCCGGCATAAACCCCTCGGATCACGTCATTACATCCTATAGGGCTCATGG  359
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.||..||||.|||.||||..|||||||.| 
Sbjct  292  GAAGCTTGCTGTGTGGGCCTGGAGGCCGGCATCAACCCCACAGACCATCTCATCACAGCCTACCGGGCTCACG-  364

Query  360  TGTGTGCTATACT------CGGGGACTTTCTGTCCGATCCATTCTCGCAGAGCTGACGGGAAGAAGAGGAGGTT  427
                 |||.||||      |||||.|||||.||||||...||||||||||||||.||.|||.|||.||||||||
Sbjct  365  -----GCTTTACTTTCACCCGGGGCCTTTCCGTCCGAGAAATTCTCGCAGAGCTTACAGGACGAAAAGGAGGTT  433

Query  428  GTGCTAAAGGAAAAGGAGGATCGATGCATATGTATACCAAGAACTTCTATGGGGGCAATGGCATCGTCGGTGCA  501
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  434  GTGCTAAAGGGAAAGGAGGATCGATGCACATGTATGCCAAGAACTTCTACGGGGGCAATGGCATCGTGGGAGCG  507

Query  502  CAGGGCCCCCTGGGCGCTGGCATTGCTCTGGCCTGTAAATATAAAGGAAACGATGAGATCTGTTTGACTTTATA  575
            ||||||                                                                    
Sbjct  508  CAGGGC--------------------------------------------------------------------  513

Query  576  TGGGGATGGCGCTGCGAATCAGGGGCAGATAGCCGAAGCTTTCAATATGGCAGCTTTATGGAAATTACCTTGTG  649
                                     ||||||..||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct  514  -------------------------CAGATATTCGAAGCTTACAACATGGCAGCTTTGTGGAAATTACCTTGTA  562

Query  650  TTTTCATCTGTGAGAATAACCTATATGGAATGGGAACATCTACTGAGAGAGCAGCAGCCAGCCCTGATTACTAC  723
            |||||||||||||||||||.|..||||||||||||||.|||..|||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct  563  TTTTCATCTGTGAGAATAATCGCTATGGAATGGGAACGTCTGTTGAGAGAGCGGCAGCCAGCACTGATTACTAC  636

Query  724  AAGAGGGGCAATTTTATCCCTGGGCTAAAGGTCGATGGAATGGATGTTCTGTGTGTTCGTGAGGCAACAAAATT  797
            |||||.|||.||||.||.||||||||.|..||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||||..||
Sbjct  637  AAGAGAGGCGATTTCATTCCTGGGCTGAGAGTGGATGGAATGGATATCCTGTGCGTCCGAGAGGCAACAAGGTT  710

Query  798  TGCAGCTAACTACTGTAGATCTGGAAAGGGGCCCATACTGATGGAGCTGCAAACCTACCGTTATCATGGACACA  871
            |||.|||..|||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  711  TGCTGCTGCCTATTGTAGATCTGGGAAGGGGCCCATCCTGATGGAGCTGCAGACTTACCGTTACCACGGACACA  784

Query  872  GTATGAGTGATCCTGGAGTCAGTTATCGTACACGAGAAGAAATTCAGGAAGTAAGAAGTAAGAGGGATCCTATA  945
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  785  GTATGAGTGACCCTGGAGTCAGTTACCGTACACGAGAAGAAATTCAGGAAGTAAGAAGTAAGAGTGACCCTATT  858

Query  946  ATAATTCTCCAAGATAGAATGGTAAACAGCAAGCTCGCCACTGTGGAAGAATTAAAGGAAATTGGGGCTGAGGT  1019
            ||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||.||.||||.||||||||||.||||||||||||..|..||.||
Sbjct  859  ATGCTTCTCAAGGACAGGATGGTGAACAGCAATCTTGCCAGTGTGGAAGAACTAAAGGAAATTGATGTGGAAGT  932

Query 1020  GAGGAAAGAAATTGATGATGCTGCCCAGTTTGCTACCACTGATCCTGAGCCACATTTGGAAGAATTAGGCCATC  1093
            ||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||..|.|||||||||||||.|||||||||..|.|||.|.|
Sbjct  933  GAGGAAGGAGATTGAGGATGCTGCCCAGTTTGCCACGGCCGATCCTGAGCCACCTTTGGAAGAGCTGGGCTACC  1006

Query 1094  ACATCTACAGCAGTGATTCATCTTTTGAAGTTCGTGGTGCAAATCCATGGATCAAGTTTAAGTCCGTCAGT  1164
            ||||||||..|||.||..||.|||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1007  ACATCTACTCCAGCGACCCACCTTTTGAAGTTCGTGGTGCCAATCAGTGGATCAAGTTTAAGTCAGTCAGT  1077