Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15561
• Subject: NM_001176528.1
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1259
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGTACGAGAGTGTAGAAGTGGGGGG------TCCCACCCCTAATCCCTTCCTAGTGGTGGATTTTTATAACCA  68
            ||||||||||||||.|||||.|||||      .|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTACGAGAGTGTGGAAGTCGGGGGCCTTACCCCCGCCCCTAACCCCTTCCTAGTGGTGGACTTTTATAACCA  74

Query   69  GAACCGGGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGGCTCCCCGCCCCGGGTCCGTACTCCACCCCGCTCCGGACTCCGC  142
            ||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAACCGGGCCTGTTTGCTCCAGGAGAAGGGGCTCCCTGCCCCGGGTCCCTACTCCACCCCACTCCGGACTCCGC  148

Query  143  TTTGGAATGGCTCAAACCACTCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCG  216
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  TTTGGAATGGCTCAAACCACTCCATCGAGACCCAGAGCAGCAGTTCCGAAGAGATAGTACCCAGCCCTCCCTCA  222

Query  217  CCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGT  290
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACCGCCCCTGCCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTTTGTCAAGACAAATCATCCGGCTACCACTATGGGGT  296

Query  291  CAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGG  364
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CAGCGCCTGTGAGGGCTGTAAGGGCTTCTTCCGACGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTATACGTGTCACCGGG  370

Query  365  ACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTG  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  371  ACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTG  444

Query  439  GGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGA  512
            |||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GGCATGTCCAAGGAGTCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGA  518

Query  513  GAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTG  586
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GAGCTACACGCTGACGCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGG  592

Query  587  CCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGG  660
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGG  666

Query  661  GACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCAC  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCAC  740

Query  735  CACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCA  808
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  CACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCA  814

Query  809  CGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAAC  882
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  815  CGCGGTACACGCCTGAGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAAC  888

Query  883  GCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGC  956
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GCTGGCTTTGGCCCCCTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGC  962

Query  957  GGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGG  1030
            .|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||
Sbjct  963  TGAGACTGGACTGCTCAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGG  1036

Query 1031  ACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATG  1104
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ACATGCTGCAAGAGCCGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATG  1110

Query 1105  TTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCT  1178
            ||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|
Sbjct 1111  TTCCCCAAGATGCTGATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATT  1184

Query 1179  GAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTC  1252
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1185  GAAGATGGAGATCCCAGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTC  1258

Query 1253  TGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGC  1326
            |.|||||||||.|||||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TAAGCGGACAGTCGGGGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGC  1332

Query 1327  CTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1371
            |||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1333  CTCAGTCCCAGCTCCCACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA  1377