Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15561
• Subject: XM_005257552.5
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1309
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ---ATGT-AC-GAGAGTG-TAGAAGTGGGGGGTCCCACCCCTA-ATCCCTTCCTAG-TGGTGGATTTTTATAAC  66
               |||| || ||.|.|| .|.||| ..||.|||.||..||.| |...|.|||.|| ||....||.|       
Sbjct    1  ATGATGTCACAGACAATGACACAAG-CCGGTGTCTCATTCCGACACAGCGTCCGAGCTGCACAATGT-------  66

Query   67  CAGAACCGGGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGGCTCCCCGC--CCCGGGTCCGTACTCCACC--CCG-----CT  131
            ||.|.|||||         |.|||.|.|...|||.||.|||  |||||  ||.|||.||.||  |||     ||
Sbjct   67  CACACCCGGG---------TGCCAAACACTTGGCCCCGCGCGACCCGG--CCCTACGCCTCCTGCCGCCGCTCT  129

Query  132  CCG-GACT--------------CCGCTTTGGAATGGC-------------------------------------  153
            ||| |.||              |||.||.||...|||                                     
Sbjct  130  CCGCGTCTCCGGGGGAGGTGGCCCGGTTCGGCCGGGCAGGGGGCTGGCGGGCGAGCCCCGCGGGCGGGCTGGCG  203

Query  154  -----------TCAAAC---CA-CTCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCC  212
                       ||  ||   || |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  AGCGGGTGATGTC--ACGGGCAGCGCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCC  275

Query  213  CTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATG  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  CTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATG  349

Query  287  GGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCAC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  GGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCAC  423

Query  361  CGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGA  497

Query  435  AGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCT  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCT  571

Query  509  CTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTC  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  CTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTC  645

Query  583  CCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCT  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCT  719

Query  657  CTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCT  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCT  793

Query  731  TCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATC  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATC  867

Query  805  TGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCA  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  TGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCA  941

Query  879  CAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  CAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATG  1015

Query  953  ATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGG  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  ATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGG  1089

Query 1027  GTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCA  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  GTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCA  1163

Query 1101  CATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCA  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  CATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCA  1237

Query 1175  CGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGAC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  CGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGAC  1311

Query 1249  ACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCC  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  ACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCC  1385

Query 1323  CAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1371
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  CAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1434