Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15561
• Subject: XM_006532592.3
• Aligned Length: 1428
• Identities: 1201
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGTACGAG--AGTGTAGAAG---------------TGGG---------------GGGT-CCCA-----CCCCT  36
            ||| .|.||  |   |||.||               ||||               |||| ||||     |||||
Sbjct    1  ATG-GCCAGCAA---TAGCAGTTCCTGCCCAACACCTGGGGGCGGGCACCTCAATGGGTACCCAGTACCCCCCT  70

Query   37  AATCC--CTT-------CCTAGT----GGTGGATTTTTATAACCAGAACCGGGCCTGTTTGCTC-CCAG-----  91
            |..||  |||       |||| |    ||||||.|.|     ||..|.||||..||     ||| ||||     
Sbjct   71  ACGCCTTCTTCTTTCCCCCTA-TGCTGGGTGGACTCT-----CCCCACCCGGCGCT-----CTCACCAGCCTCC  133

Query   92  AGAAGGGGCTCCCCGCCCCGGGTCCGTACTCCACCCCGCTCCGGACTCCGCTTTGGAATGGCTCAAACCACTCC  165
            ||.|...|||.||.|.|...|||   |||..|||.||| |||                     |.|.|||  ||
Sbjct  134  AGCACCAGCTTCCAGTCAGTGGT---TACAGCACACCG-TCC---------------------CCAGCCA--CC  180

Query  166  ATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTA  239
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  181  ATCGAGACCCAGAGCAGCAGTTCCGAAGAGATAGTACCCAGCCCTCCCTCACCACCGCCCCTGCCCCGCATCTA  254

Query  240  CAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGG  313
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  255  CAAGCCTTGCTTTGTTTGTCAAGACAAATCATCCGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGTAAGG  328

Query  314  GCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAG  387
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  GCTTCTTCCGACGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTATACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAG  402

Query  388  GTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAG  461
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  403  GTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTGGGCATGTCCAAGGAGTCGGTGCG  476

Query  462  AAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGG  535
            ||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  477  AAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGAGAGCTACACGCTGACGCCTGAGG  550

Query  536  TGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATAC  609
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  551  TGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAGTAC  624

Query  610  ACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCAC  683
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  ACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCAC  698

Query  684  CAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGA  757
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  CAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGA  772

Query  758  TCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGAC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  773  TCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCACGCGGTACACGCCTGAGCAAGAC  846

Query  832  ACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGA  905
            ||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  847  ACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAACGCTGGCTTTGGCCCCCTCACCGA  920

Query  906  CCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCA  979
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||
Sbjct  921  CTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGCTGAGACTGGACTGCTCAGTGCCA  994

Query  980  TCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTG  1053
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  995  TCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGGACATGCTGCAAGAGCCGCTGCTG  1068

Query 1054  GAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGAT  1127
            ||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1069  GAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATGTTCCCCAAGATGCTGATGAAGAT  1142

Query 1128  TACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCA  1201
            .||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1143  CACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATTGAAGATGGAGATCCCAGGCTCCA  1216

Query 1202  TGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGG  1275
            ||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||.||.
Sbjct 1217  TGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTCTAAGCGGACAGTCGGGGGGCGGA  1290

Query 1276  GGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAG  1349
            ...||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1291  ACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGTCCCAGCTCCCACAGAAG  1364

Query 1350  CAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1371
            ||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1365  CAGCCCAGCCACCCAATCCCCA  1386