Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15561
• Subject: XM_011525095.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1298
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  --------------------ATGTACGAGA-GTGTAGAAGTGGGGGGTCCCACCCCTAA-----------TCCC  42
                                .||..|||.| .||     |.||.|||   ||||.| ||           |.||
Sbjct    1  ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTG-----GGGGCGGG---CACCTC-AATGGGTACCCGGTGCC  65

Query   43  TTCCTAGTGGTGGATTTTTATAACCAGAACCGGGCCTGTTTGCTCCCAGAGAAGGGG------CTCCCCGCCCC  110
            |.||||    .|..||.||.|..|          ||..|.||||          |||      |||||||||..
Sbjct   66  TCCCTA----CGCCTTCTTCTTCC----------CCCCTATGCT----------GGGTGGACTCTCCCCGCCAG  115

Query  111  GGGTCCGTACT--CCAC---CCCGCTCCGGACTCCGCTT--TGGA-ATGGCTCAAACCA--------CTCCATT  168
            |    ||..||  ||||   ||.||.||.|..|||..||  |||| ||.|  ||.||||        |.|||||
Sbjct  116  G----CGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAGTTAGTGGATATAG--CACACCATCCCCAGCCACCATT  183

Query  169  GAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAA  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  GAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAA  257

Query  243  GCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCT  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  GCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCT  331

Query  317  TCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTG  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  TCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTG  405

Query  391  ACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAA  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAA  479

Query  465  CGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGG  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  CGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGG  553

Query  539  GGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACT  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACT  627

Query  613  ACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAA  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  ACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAA  701

Query  687  GTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCA  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  GTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCA  775

Query  761  CCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACC  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  CCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACC  849

Query  835  ATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCT  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  ATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCT  923

Query  909  GGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCT  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  GGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCT  997

Query  983  GCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  GCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAG  1071

Query 1057  GCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTAC  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  GCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTAC  1145

Query 1131  TGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGC  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146  TGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGC  1219

Query 1205  CGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGG  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  CGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGG  1293

Query 1279  CGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAG  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  CGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAG  1367

Query 1353  CCCGGCCACCCACTCCCCG  1371
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1368  CCCGGCCACCCACTCCCCG  1386