Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15579
• Subject: XM_011247553.2
• Aligned Length: 789
• Identities: 596
• Gaps: 54

Alignment

Query   1  ATGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCACTTAAAGCGTGTTGCAGCGCCGAAGCATTGGATGCTTGACAAACTAACGGG  74
                                                                 |||||.||.||..|.||.||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------ATGCTGGATAAGTTGACTGG  20

Query  75  TGTATTTGCACCTCGTCCATCGACAGGTCCCCACAAGCTGAGGGAATGTCTTCCTCTGATCGTCTTCCTCAGGA  148
           .||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||
Sbjct  21  CGTGTTTGCTCCTCGTCCATCCACTGGTCCTCACAAGCTGAGGGAATGCCTGCCTCTCATCATTTTCCTAAGGA  94

Query 149  ATAGACTCAAGTATGCGTTGACTGGAGATGAGGTAAAGAAGATATGTATGCAACGTTTCATCAAAATTGATGGC  222
           |.|||||.||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  95  ACAGACTTAAGTATGCCCTGACTGGAGATGAAGTAAAAAAGATTTGCATGCAGCGATTCATTAAGATTGATGGG  168

Query 223  AAGGTTCGAGTGGATGTCACATACCCTGCTGGATTCATGGATGTCATCAGCATCGAGAAGACAGGTGAACATTT  296
           ||.||..|....|||.|.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||..|.||
Sbjct 169  AAAGTCAGGACCGATATAACCTACCCTGCTGGGTTTATGGATGTCATCAGCATTGACAAGACCGGAGAGAACTT  242

Query 297  CCGCCTGGTCTATGACACCAAGGGCCGTTTTGCTGTTCACCGCATCACAGTGGAAGAGGCAAAGTACAAGTTGT  370
           |||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||..|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 243  CCGTCTGATCTATGACACCAAGGGTCGCTTTGCTGTTCATCGTATTACACCGGAGGAGGCCAAGTACAAGTTGT  316

Query 371  GCAAAGTGAGGAAGATTACTGTGGGAGTGAAGGGAATCCCTCACCTGGTGACTCATGATGCTCGAACCATCCGC  444
           ||||||||||.|||||...|||.||....||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 317  GCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTAGGCACAAAAGGAATCCCGCACCTGGTGACCCATGATGCTCGTACTATTCGG  390

Query 445  TACCCAGATCCTGTCATCAAGGTGAACGATACTGTGCAGATTGATTTAGGGACTGGCAAGATAATCAACTTTAT  518
           |||||.|||||..||||||||||||||||.||..|.|||||||||||.|.|||.|||||.||||...||||.||
Sbjct 391  TACCCTGATCCCCTCATCAAGGTGAACGACACCATTCAGATTGATTTGGAGACAGGCAAAATAACTGACTTCAT  464

Query 519  CAAATTTGATACAGGCAATTTGTGTATGGTGATTGGTGGAGCCAACCTCGGTCGTGTTGGTGTGATCACCAACA  592
           |||.|||||.||.||.||..||||||||||||.|||.||.||.|||.|.||..|..|||||||.||||||||||
Sbjct 465  CAAGTTTGACACTGGGAACCTGTGTATGGTGACTGGAGGTGCTAACTTGGGAAGAATTGGTGTAATCACCAACA  538

Query 593  GGGAAAGACATCCTGGTTCTTTTGATGTGGTGCATGTGAAGGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACGAGGCTT  666
           |.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.
Sbjct 539  GAGAGAGACATCCCGGCTCTTTTGATGTGGTTCATGTGAAAGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACTCGGCTG  612

Query 667  TCCAACATTTTTGTCATTGGCAATGGCAATAAACCTTGGATTTCCCTGCCCAGGGGAAAGGGCATTCGACTTAC  740
           ||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct 613  TCCAACATTTTTGTTATTGGCAAGGGTAACAAACCATGGATCTCTCTTCCCAGAGGAAAAGGAATCCGCCTCAC  686

Query 741  TGTTGCTGAAGAGAGAGATAAGAGGCTGGCCACCAAACAGAGCAGTGGC  789
           ..||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.
Sbjct 687  CATTGCTGAAGAGAGAGACAAGAGGCTTGCGGCCAAACAGAGCAGTGGG  735