Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15619
• Subject: NM_001184783.2
• Aligned Length: 927
• Identities: 849
• Gaps: 78

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGAGCTGGTGTAATGAGCTCAGATTGCCTGCCCTTAAGCAGCACAGCATTGGCCGAGGACTTGAGAGTCACAT  74

Query   1  ----ATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTT  70
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TACAATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTT  148

Query  71  TTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCGTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAAT  144
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCGTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAAT  222

Query 145  ACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGA  218
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGA  296

Query 219  AAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGA  292
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGA  370

Query 293  CATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGT  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGT  444

Query 367  ATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGA  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGA  518

Query 441  GGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGG  514
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGG  592

Query 515  GCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAG  588
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAG  666

Query 589  AAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCAT  662
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  AAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCAT  740

Query 663  TGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAG  736
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAG  814

Query 737  GCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCT  810
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCT  888

Query 811  GGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  849
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  GGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  927