Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15619
• Subject: NM_001324087.1
• Aligned Length: 851
• Identities: 751
• Gaps: 88

Alignment

Query   1  ATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTTTTGG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCA-GTGGC-GTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATAC  146
                     .||..|||||...||....||  || |.||| |.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------ATGCTTGTGATCCCAGCTACT--CAGGAGGCTGAGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATAC  62

Query 147  AGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAA  220
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  63  AGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAA  136

Query 221  AGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACA  294
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137  AGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACA  210

Query 295  TTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTAT  368
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211  TTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTAT  284

Query 369  AAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGG  442
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285  AAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGG  358

Query 443  GCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGC  516
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359  GCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGC  432

Query 517  TACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAA  590
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433  TACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAA  506

Query 591  AGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTG  664
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507  AGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTG  580

Query 665  CAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGC  738
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581  CAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGC  654

Query 739  TATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGG  812
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655  TATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGG  728

Query 813  AGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  849
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729  AGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  765