Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15619
• Subject: NM_001324088.1
• Aligned Length: 882
• Identities: 849
• Gaps: 33

Alignment

Query   1  ---------------------------------ATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGC  41
                                            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGACCCACGGACAGACTTGCGCGCGTCCAATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGC  74

Query  42  CAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCG  115
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCAGTGGCG  148

Query 116  TGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAG  189
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAG  222

Query 190  TGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGA  263
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGA  296

Query 264  AGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTA  337
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTA  370

Query 338  AAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCA  411
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCA  444

Query 412  ATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATC  485
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATC  518

Query 486  AAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATG  559
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATG  592

Query 560  GGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACA  633
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACA  666

Query 634  TCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAA  707
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTGCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAA  740

Query 708  AGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTG  781
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  AGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTG  814

Query 782  CTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  849
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  CTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT  882