Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15619
- Subject:
- NM_001324090.1
- Aligned Length:
- 851
- Identities:
- 751
- Gaps:
- 88
Alignment
Query 1 ATGTGTATTCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACAAAGGATTTGGTTTTGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACAAAGTCTTGCA-GTGGC-GTGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATAC 146
.||..|||||...||....|| || |.||| |.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------ATGCTTGTGATCCCAGCTACT--CAGGAGGCTGAGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATCTAATAC 62
Query 147 AGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAA 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 AGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGTGGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAA 136
Query 221 AGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACA 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 AGTGGAACACTGATAACACTCTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGATTTGTCAAGGTTTGAAACTGACA 210
Query 295 TTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTAT 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 TTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTAT 284
Query 369 AAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGG 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 AAACCTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTCAGCTGTCTTTGGTTATGAGG 358
Query 443 GCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGC 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTGACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGC 432
Query 517 TACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAA 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 TACAGGACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTCAATGATGGGACAGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAA 506
Query 591 AGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTG 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 AGTTTGTGAAGATCTTGACACTTCAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATTG 580
Query 665 CAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGC 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 CAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGCAAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGC 654
Query 739 TATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGG 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TATACTCAGACTCTGAGGCCTGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGGAAGAGCATTAATGCTGG 728
Query 813 AGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT 849
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 AGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGAGGCT 765