Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15665
• Subject: NM_008961.3
• Aligned Length: 1050
• Identities: 890
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAGTCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGAC  74
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTCCTTAAGTGGGAAAGTACAAACAGTTCTGGGCCTTGTAGAACCCAGCCAACTGGGACGCACCCTGAC  74

Query   75  CCATGAACACCTGGCCATGACCTTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAG  148
            |||.||.||.|||.|.||||||||||||.|.|.||||||.||||||||.||.|||||.||||..|..|||||.|
Sbjct   75  CCACGAGCATCTGACAATGACCTTTGACAGTTTTTACTGCCCACCTCCTCCATGCCACGAAGTCACCTCCAAGG  148

Query  149  AACCTATCGTGATGAAAAATTTATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAAT  222
            ||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||..|||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AACCTATCATGATGAAAAATCTATTTTGGATTCAGAAAAACCCCTATTCCCATCGAGAGAACCTTCAGTTGAAT  222

Query  223  CAGGAGACAGAAGCCATAAAGGAAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACAC  296
            ||||||..||.||||||||..|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||
Sbjct  223  CAGGAGGTAGGAGCCATAAGAGAAGAGCTGTTGTATTTCAAGGCTAAGGGCGGAGGAGCCTTGGTGGAGAATAC  296

Query  297  AACCACTGGGATTAGCCGAGACACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTG  370
            .||.||||||.|.|||.|.|||...||.|||.|||||.||||.|||||..|||||||.|||||.||||||.|||
Sbjct  297  GACAACTGGGCTCAGCAGGGACGTGCATACGCTGAAGTGGCTGGCAGAGCAGACTGGAGTCCACATCATAGCTG  370

Query  371  GAGCCGGGTTTTATGTGGATGCAACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTC  444
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||..|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  GAGCTGGGTTTTATGTTGATGCAACTCACTCTGCAGCAACCAGAGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACAGATGTC  444

Query  445  CTTATGAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTC  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CTTATTAATGAAATTCTCCATGGAGCTGATGGCACCAGCATCAAGTGTGGAGTTATTGGAGAAATTGGCTGCTC  518

Query  519  CTGGCCTTTGACTGAGAGTGAAAGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTG  592
            |||||||||||||||.||.||.||||||.|.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CTGGCCTTTGACTGACAGCGAGAGAAAGATACTTGAGGCTACAGCTCACGCCCAGGCTCAGCTTGGCTGTCCTG  592

Query  593  TTATTATCCATCCTGGACGGAGCTCCAGG-GCACCATTCCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGA  665
            |.||.||||||||||||||||.| ||||| ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||
Sbjct  593  TCATCATCCATCCTGGACGGAAC-CCAGGTGCACCATTCCAGATAATCCGTATACTGCAAGAAGCAGGAGCAGA  665

Query  666  CATCTCCAAAACAGTCATGTCACACCTGGATAGGACTATTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAGC  739
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct  666  CATCTCCAAAACAGTCATGTCCCACCTTGACAGGACTATATTTGATAAGAAAGAGCTGCTGGAGTTTGCTCAAC  739

Query  740  TTGGCTGCTACTTGGAATATGATCTCTTTGGTACTGAACTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATG  813
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||||||..|..|||||||||||||.|||
Sbjct  740  TTGGCTGCTACTTGGAATACGATCTCTTTGGTACGGAACTCCTTAATTACCAGTTGAGCCCAGATATTGATATG  813

Query  814  CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGC  887
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||||.|||||||.|||||||||.|||||..|.||
Sbjct  814  CCTGATGATAACAAAAGAATTAGAAGGGTCCATTTTCTAGTGGATGAGGGCTATGAAGATCGGATTCTCATGGC  887

Query  888  ACATGACATACATACGAAAACC--CGGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGT  959
            ||||||||||||.||  |||.|  |||.|||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||..|
Sbjct  888  ACATGACATACACAC--AAAGCATCGGTTGATGAAGTACGGAGGTCACGGCTACTCACACATCCTTACCAACAT  959

Query  960  TGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGCATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAAT  1033
            |||||||||.|||.|.||.|||||..|.|||||||..||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  960  TGTTCCTAAGATGCTCCTTAGAGGTCTGACTGAGAGGGTGCTTGACAAGATACTCATAGAAAACCCTAAACAAT  1033

Query 1034  GGCTAACTTTCAAA  1047
            ||||.|||||.|||
Sbjct 1034  GGCTGACTTTTAAA  1047