Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15665
• Subject: XM_017016928.2
• Aligned Length: 1173
• Identities: 905
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTGAGTCCTGTGCACTCTTGCTTAATCCACTCTGCAGCCCTGTGAAGGATTCTAGTGATAACGACAAAGC  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAG  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAGAAAAAAGAAATCCTCTTTTTAGAACATCTCTTGGTGGTACCATCAGAAATGTCTTCCTTAAGTGGAAAAG  148

Query   23  TCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACC  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCAAACCGTTTTGGGCCTTGTAGAGCCAAGCAAACTGGGCCGTACCCTGACCCATGAACACCTGGCCATGACC  222

Query   97  TTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTT  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGACTGCTGTTACTGTCCACCTCCCCCGTGCCAGGAAGCTATTTCCAAAGAACCTATCGTGATGAAAAATTT  296

Query  171  ATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGG  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATTGGATTCAGAAAAACGCCTATTCCCATAAAGAAAACCTTCAATTAAATCAGGAGACAGAAGCCATAAAGG  370

Query  245  AAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGAC  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAACTGTTGTATTTTAAAGCTAATGGTGGAGGGGCTTTGGTGGAAAACACAACCACTGGGATTAGCCGAGAC  444

Query  319  ACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGC  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACACAGACGTTGAAGAGGCTTGCAGAAGAGACTGGCGTCCATATCATATCTGGAGCCGGGTTTTATGTGGATGC  518

Query  393  AACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATG  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTCACTCCTCAGAGACCAGGGCCATGTCAGTGGAGCAGCTTACCGATGTCCTTATGAATGAAATTCTCCATG  592

Query  467  GAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGCTGATGGAACCAGTATCAAGTGTGGCATTATTGGAGAAATTGGTTGCTCCTGGCCTTTGACTGAGAGTGAA  666

Query  541  AGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAG  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAAAGGTTCTCCAGGCCACAGCTCATGCCCAGGCTCAGCTTGGTTGTCCTGTTATTATCCATCCTGGACGGAG  740

Query  615  CTCCAGGGCACCATTCCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCAC  688
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGGGCACCATTTCAGATTATCCGAATATTGCAAGAAGCAGGCGCAGACATCTCCAAAACAGTCATGTCAC  814

Query  689  ACCTGGATAGGACTATTCTTGATAAGAAAGAGCTCTTGGAGTTTGCTCAGCTTGGCTGCTACTTGGAATATGAT  762
            ||||||||                                                                  
Sbjct  815  ACCTGGAT------------------------------------------------------------------  822

Query  763  CTCTTTGGTACTGAACTACTTCATTACCAACTCGGCCCAGATATTGACATGCCTGATGATAACAAAAGAATTAG  836
                                                                                      
Sbjct  823  --------------------------------------------------------------------------  822

Query  837  AAGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACCC  910
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  -AGGGTGCGTCTCCTGGTGGAAGAGGGCTGTGAAGATCGAATTCTGGTAGCACATGACATACATACGAAAACCC  895

Query  911  GGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGC  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  GGCTGATGAAATATGGAGGTCACGGCTATTCTCATATACTCACCAATGTTGTTCCTAAAATGTTGCTGAGAGGC  969

Query  985  ATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA  1047
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  970  ATAACTGAGAATGTGCTTGATAAGATTCTAATAGAGAACCCTAAGCAATGGCTAACTTTCAAA  1032