Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15706
• Subject: NM_207312.3
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1142
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG  74
            |||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG  74

Query   75  CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCA  148
            |||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA  148

Query  149  ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC  222
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct  149  ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG  222

Query  223  ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAAGATGC  296
            .|.||||||||.|||||.||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC  296

Query  297  TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCA  370
            .||||.|||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct  297  AGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA  370

Query  371  AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG  444
            |.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG  444

Query  445  TTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAATCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC  518
            |||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  445  TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC  518

Query  519  GGCACCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT  592
            .||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACATT  592

Query  593  CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA  666
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||.||.||.
Sbjct  593  CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC  666

Query  667  ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC  740
            ||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct  667  ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC  740

Query  741  CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT  814
            |||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT  814

Query  815  ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT  888
            |.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  815  ACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC  888

Query  889  GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG  962
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct  889  GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG  962

Query  963  TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGTGGATT  1036
            .||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGATT  1036

Query 1037  GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG  1110
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG  1110

Query 1111  GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT  1184
            ||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||.|||.|||||
Sbjct 1111  GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGTT  1184

Query 1185  TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG  1258
            .||.||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185  CGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG  1258

Query 1259  AGGCCCGTGAAGATATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT  1332
            |||||||.||.||..||||.||.||.||||||||||.|||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259  AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT  1332

Query 1333  GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC  1353
               ||||||||.||.|.||||
Sbjct 1333  ---GAAGAAGGCGAAGCATAC  1350