Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15707
- Subject:
- NM_207312.3
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1143
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGCGTGAGTGCATCTCCATCCACGTTGGCCAGGCTGGTGTCCAGATTGGCAATGCCTGCTGGGAGCTCTACTG 74
|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGCGCGAGTGTATCTCTATCCACGTGGGGCAGGCGGGTGTCCAGATCGGCAATGCCTGCTGGGAACTGTACTG 74
Query 75 CCTGGAACACGGCATCCAGCCCGATGGCCAGATGCCAAGTGACAAGACCATTGGGGGAGGAGATGACTCCTTCA 148
|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 75 CCTTGAACATGGAATTCAGCCCGATGGTCAAATGCCAAGTGATAAAACCATTGGTGGCGGGGACGACTCCTTCA 148
Query 149 ACACCTTCTTCAGTGAGACGGGCGCTGGCAAGCACGTGCCCCGGGCTGTGTTTGTAGACTTGGAACCCACAGTC 222
||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.
Sbjct 149 ACACGTTCTTCAGTGAGACTGGAGCTGGCAAGCACGTGCCCAGAGCAGTGTTTGTGGACCTGGAGCCCACTGTG 222
Query 223 ATTGATGAAGTTCGCACTGGCACCTACCGCCAGCTCTTCCACCCTGAGCAGCTCATCACAGGCAAGGAAGATGC 296
.|.||||||||.|||||.||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GTCGATGAAGTGCGCACAGGGACCTACAGGCAGCTCTTCCACCCAGAGCAGCTGATCACCGGGAAGGAAGATGC 296
Query 297 TGCCAATAACTATGCCCGAGGGCACTACACCATTGGCAAGGAGATCATTGACCTTGTGTTGGACCGAATTCGCA 370
.||||.|||.||.|||.|.||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.||..|||||||.||.||||
Sbjct 297 AGCCAGTAATTACGCCAGGGGCCATTACACCATCGGCAAGGAGATTGTTGACCTAGTCCTGGACCGGATCCGCA 370
Query 371 AGCTGGCTGACCAGTGCACCGGTCTTCAGGGCTTCTTGGTTTTCCACAGCTTTGGTGGGGGAACTGGTTCTGGG 444
|.|||||.||.|.||||||.||.||.|||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 371 AACTGGCGGATCTGTGCACAGGACTGCAGGGCTTCCTCATCTTCCACAGCTTTGGGGGCGGCACTGGCTCTGGG 444
Query 445 TTCACCTCCCTGCTCATGGAACGTCTCTCAGTTGATTATGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAGTTCTCCATTTACCC 518
|||.|.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 445 TTCGCATCTCTGCTCATGGAGCGGCTCTCAGTGGATTACAGCAAGAAGTCCAAGCTAGAGTTTGCCATTTACCC 518
Query 519 GGCACCCCAGGTTTCCACAGCTGTAGTTGAGCCCTACAACTCCATCCTCACCACCCACACCACCCTGGAGCACT 592
.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AGCCCCCCAGGTCTCCACAGCCGTGGTGGAGCCCTACAACTCCATCCTAACCACCCACACGACCCTGGAACATT 592
Query 593 CTGATTGTGCCTTCATGGTAGACAATGAGGCCATCTATGACATCTGTCGTAGAAACCTCGATATCGAGCGCCCA 666
||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.||.||.||.
Sbjct 593 CTGACTGTGCCTTCATGGTCGACAATGAAGCCATCTATGACATATGTCGGCGCAACCTGGACATTGAACGTCCC 666
Query 667 ACCTACACTAACCTTAACCGCCTTATTAGCCAGATTGTGTCCTCCATCACTGCTTCCCTGAGATTTGATGGAGC 740
||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.||
Sbjct 667 ACGTACACCAACCTCAATCGCCTGATTGGGCAGATCGTGTCCTCCATCACGGCCTCCCTGCGATTTGATGGGGC 740
Query 741 CCTGAATGTTGACCTGACAGAATTCCAGACCAACCTGGTGCCCTACCCCCGCATCCACTTCCCTCTGGCCACAT 814
|||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCTGAATGTGGACTTGACGGAATTCCAGACCAACCTCGTGCCGTACCCCCGCATCCACTTCCCCCTGGCCACCT 814
Query 815 ATGCCCCTGTCATCTCTGCTGAGAAAGCCTACCATGAACAGCTTTCTGTAGCAGAGATCACCAATGCTTGCTTT 888
|.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 ACGCCCCAGTCATCTCAGCTGAGAAGGCCTACCACGAGCAGCTGTCTGTGGCCGAGATCACCAATGCCTGCTTC 888
Query 889 GAGCCAGCCAACCAGATGGTGAAATGTGACCCTCGCCATGGTAAATACATGGCTTGCTGCCTGTTGTACCGTGG 962
|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.||||||||.|.||
Sbjct 889 GAGCCAGCCAATCAGATGGTCAAGTGTGACCCTCGCCATGGCAAGTACATGGCCTGCTGCATGTTGTACAGGGG 962
Query 963 TGACGTGGTTCCCAAAGATGTCAATGCTGCCATTGCCACCATCAAAACCAAGCGCAGCATCCAGTTTGTGGATT 1036
.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 963 GGACGTGGTCCCCAAAGACGTCAATGCGGCCATCGCCACCATCAAGACCAAGCGCACTATCCAGTTTGTGGATT 1036
Query 1037 GGTGCCCCACTGGCTTCAAGGTTGGCATCAACTACCAGCCTCCCACTGTGGTGCCTGGTGGAGACCTGGCCAAG 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTGCCCGACTGGATTTAAGGTGGGCATTAACTACCAGCCCCCCACAGTGGTCCCCGGGGGAGACCTGGCCAAG 1110
Query 1111 GTACAGAGAGCTGTGTGCATGCTGAGCAACACCACAGCCATTGCTGAGGCCTGGGCTCGCCTGGACCACAAGTT 1184
||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||.|||.|||||
Sbjct 1111 GTGCAGCGGGCCGTGTGCATGCTGAGCAACACCACGGCCATTGCGGAGGCCTGGGCCCGCCTGGTCCATAAGTT 1184
Query 1185 TGACCTGATGTATGCCAAGCGTGCCTTTGTTCACTGGTACGTGGGTGAGGGGATGGAGGAAGGCGAGTTTTCAG 1258
.||.||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1185 CGATCTCATGTATGCCAAGTGGGCCTTTGTGCACTGGTACGTGGGCGAAGGCATGGAAGAGGGAGAGTTCTCTG 1258
Query 1259 AGGCCCGTGAAGATATGGCTGCCCTTGAGAAGGATTATGAGGAGGTTGGTGTGGATTCTGTTGAAGGAGAGGGT 1332
|||||||.||.||..||||.||.||.||||||||||.|||.|||||.||.||||||||.||.||||..||||.|
Sbjct 1259 AGGCCCGCGAGGACCTGGCAGCTCTAGAGAAGGATTGTGAAGAGGTGGGCGTGGATTCCGTGGAAGCTGAGGCT 1332
Query 1333 GAGGAAGAAGGAGAGGAATAC 1353
||||||||.||.|.||||
Sbjct 1333 ---GAAGAAGGCGAAGCATAC 1350