Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15847
• Subject: NM_001284202.1
• Aligned Length: 957
• Identities: 914
• Gaps: 42

Alignment

Query   1  --------------------------------ATGG----------CATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGAC  32
                                           .|||          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAAAGGAGAAATTCAACAGTCGCTTGGAGCCTGGGTTTTGCTTACATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGAC  74

Query  33  CCTATTATTTAAAAATGGCTCAACTGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATG  106
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCTATTATTTAAAAATGGCTCAACTGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATG  148

Query 107  CACAGAAATATTGTCAGCCTTGCACAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATG  180
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CACAGAAATATTGTCAGCCTTGCACAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATG  222

Query 181  CTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACA  254
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTCTTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACA  296

Query 255  CATCACTGCATTATTTGAATGCAGCATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTT  328
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATCACTGCATTATTTGAATGCAGCATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTT  370

Query 329  ATATTCGTTCATGTCGAGTATTGATGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTT  402
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATATTCGTTCATGTCGAGTATTGATGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTT  444

Query 403  ACCACAGTACACTGTACTCATGAAGCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTT  476
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACCACAGTACACTGTACTCATGAAGCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTT  518

Query 477  GGTATTAATGATGCTGCTCCGACCTCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTA  550
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GGTATTAATGATGCTGCTCCGACCTCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTA  592

Query 551  AAAGTATTTATGCTGCACTTTACTTCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATAT  624
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AAAGTATTTATGCTGCACTTTACTTCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATAT  666

Query 625  TACGCCTTCCCATACATTATATTAGTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGA  698
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TACGCCTTCCCATACATTATATTAGTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGA  740

Query 699  GAACTGCTATGATCTTCTGGTCAGAAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATG  772
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GAACTGCTATGATCTTCTGGTCAGAAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATG  814

Query 773  GAATAATCTCCATTTCCAGAGTGGATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCC  846
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  GAATAATCTCCATTTCCAGAGTGGATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCC  888

Query 847  CTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAATTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  915
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  CTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAATTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  957