Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15847
• Subject: NM_001284204.1
• Aligned Length: 933
• Identities: 621
• Gaps: 312

Alignment

Query   1  ATG------------------GCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  56
           |||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74

Query  57  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  130
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148

Query 131  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  204
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222

Query 205  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  278
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296

Query 279  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  352
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370

Query 353  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  426
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444

Query 427  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  500
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518

Query 501  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  574
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592

Query 575  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  648
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTA---------------------------  639

Query 649  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  722
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 723  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  796
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 797  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  870
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 871  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  915
                                                        
Sbjct 640  ---------------------------------------------  639