Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15862
• Subject: NM_024181.2
• Aligned Length: 2384
• Identities: 2083
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGGAGTCTGGTTAAATAAAGATGACTATATCAGAGACTTGAAAAGGATCATTCTCTGTTTTCTGATAGTGTA  74
            |||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||.||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGAGTCTGGTTAAACAAAGATGACTTTATCAGAGACTTGAAGAGGATCAGTCTCTGTCTTCTGATACTGTA  74

Query   75  TATGGCCATTTTAGTGGGCACAGATCAGGATTTTTACAGTTTACTTGGAGTGTCCAAAACTGCAAGCAGTAGAG  148
            ..|||.|.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGGTCGTTGTGGTGGGCACAGATCAGAATTTTTACAGTTTACTTGGAGTGTCGAAAACTGCAAGCAGTAGAG  148

Query  149  AAATAAGACAAGCTTTCAAGAAATTGGCATTGAAGTTACATCCTGATAAAAACCCGAATAACCCAAATGCACAT  222
            |||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATAAGACAAGCCTTTAAGAAATTAGCACTGAAGTTACATCCTGATAAAAACCCGAATAACCCAAATGCACAT  222

Query  223  GGCGATTTTTTAAAAATAAATAGAGCATATGAAGTACTCAAAGATGAAGATCTACGGAAAAAGTATGACAAATA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGATTTTTTAAAAATAAATAGAGCATATGAAGTACTCAAAGATGAAGATCTACGGAAAAAGTATGACAAATA  296

Query  297  TGGAGAAAAGGGACTTGAGGATAATCAAGGTGGCCAGTATGAAAGCTGGAACTATTATCGTTATGATTTTGGTA  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||.||.|||||.|||||.||||
Sbjct  297  TGGAGAAAAGGGACTTGAAGATAATCAAGGAGGCCAGTATGAGAGCTGGAGCTACTACCGTTACGATTTCGGTA  370

Query  371  TTTATGATGATGATCCTGAAATCATAACATTGGAAAGAAGAGAATTTGATGCTGCTGTTAATTCTGGAGAACTG  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  TTTACGATGATGATCCTGAAATCATAACATTAGAAAGAAGAGAATTTGATGCTGCTGTCAACTCTGGAGAACTG  444

Query  445  TGGTTTGTAAATTTTTACTCCCCAGGCTGTTCACACTGCCATGATTTAGCTCCCACATGGAGAGACTTTGCTAA  518
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  TGGTTTGTAAACTTTTACTCCCCAGGATGTTCGCATTGCCATGATTTAGCCCCCACTTGGAGAGAATTTGCTAA  518

Query  519  AGAAGTGGATGGGTTACTTCGAATTGGAGCTGTTAACTGTGGTGATGATAGAATGCTTTGCCGAATGAAAGGAG  592
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGTGGATGGGTTGCTTCGAATCGGAGCTGTCAACTGTGGTGATGATCGGATGCTCTGCCGAATGAAAGGAG  592

Query  593  TCAACAGCTATCCCAGCCTCTTCATTTTTCGGTCTGGAATGGCCCCAGTGAAATATCATGGAGACAGATCAAAG  666
            |.||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||..|||||||.||..|||||||..|.||||||
Sbjct  593  TTAACAGCTACCCCAGCCTCTTCATCTTTAGGTCTGGAATGGCTGCAGTGAAGTACAATGGAGATCGGTCAAAG  666

Query  667  GAGAGTTTAGTGAGTTTTGCAATGCAGCATGTTAGAAGTACAGTGACAGAACTTTGGACAGGAAATTTTGTCAA  740
            |||||.||||||...||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|..||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAGAGCTTAGTGGCCTTCGCCATGCAGCACGTCAGGAGCACAGTGACAGAGCTGTCAACAGGAAATTTTGTTAA  740

Query  741  CTCCATACAAACTGCTTTTGCTGCTGGTATTGGCTGGCTGATCACTTTTTGTTCAAAAGGAGGAGATTGTTTGA  814
            ..|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  741  TGCCATAGAAACTGCTTTTGCTGCTGGTGTTGGCTGGCTGATCACATTCTGCTCTAAAGGAGAAGATTGTTTGA  814

Query  815  CTTCACAGACACGACTCAGGCTTAGTGGCATGTTGGATGGTCTTGTTAATGTAGGATGGATGGACTGTGCCACC  888
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|.||
Sbjct  815  CATCACAGACCCGACTCAGGCTTAGTGGCATGTTGGACGGCCTTGTTAACGTGGGATGGGTGGACTGTGACGCC  888

Query  889  CAGGATAACCTTTGTAAAAGCTTAGATATTACAACAAGTACTACTGCTTATTTTCCTCCTGGAGCCACTTTAAA  962
            |||||.|.|||.||.||.|||.|.||||..|||.|.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CAGGACAGCCTCTGCAAGAGCCTGGATACCACAGCCAGCACCACGGCTTATTTCCCTCCTGGAGCCACTTTGAA  962

Query  963  TAACAAAGAGAAAAA--CAGTATTTTGTTTCTCAACTCATTGGATGCTAAAGAAATATATTTGGAAGTAATACA  1034
            |.||  ||.||||||  ||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..|||||.|.|||||
Sbjct  963  TGAC--AGGGAAAAATCCAGTGTGTTGTTTCTTAATTCATTGGATGCTAAGGAAATATACATGGAAATCATACA  1034

Query 1035  TAATCTTCCAGATTTTGAACTACTTTCGGCAAA-CACACTAGAGGATCGTTTGGCTCATCATCGGTGGCTGTTA  1107
            ||||||||||||.||||||||.|||||.||||| || ||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||
Sbjct 1035  TAATCTTCCAGACTTTGAACTGCTTTCAGCAAATCA-ACTAGAGGATCGTTTGGCACATCATCGCTGGCTTGTA  1107

Query 1108  TTTTTTCATTTTGGAAAAAATGAAAATTCAAATGATCCTGAGCTGAAAAAACTAAAAACTCTACTTAAAAATGA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TTTTTTCATTTTGGAAAAAATGAAAACGCAAATGATCCTGAGTTGAAAAAACTGAAAACTCTACTTAAAAATGA  1181

Query 1182  TCATATTCAAGTTGGCAGGTTTGACTGTTCCTCTGCACCAGACATCTGTAGTAATCTGTATGTTTTTCAGCCGT  1255
            .||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|.||||||...|.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1182  GCATATTCAAGTTGGAAGGTTTGATTGCTCTTCTGCACCGGGCATCTGCTCTGATCTTTATGTCTTCCAGCCCT  1255

Query 1256  CTCTAGCAGTATTTAAAGGACAAGGAACCAAAGAATATGAAATTCATCATGGAAAGAAGATTCTATATGATATA  1329
            ..||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1256  GCCTAGCAGTGTTTAAAGGACAAGGAACCAAAGAATATGAAATTCATCATGGAAAGAAGATTCTATACGATATA  1329

Query 1330  CTTGCCTTTGCCAAAGAAAGTGTGAATTCTCATGTTACCACGCTTGGACCTCAAAATTTTCCTGCCAATGACAA  1403
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|.||||||
Sbjct 1330  CTTGCTTTTGCCAAAGAAAGTGTTAATTCTCATGTTACCACACTTGGACCTCAGAACTTCCCTGCAAGTGACAA  1403

Query 1404  AGAACCATGGCTTGTTGATTTCTTTGCCCCCTGGTGTCCACCATGTC--GAGCTTTACTACCAGAGTTACGAAG  1475
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||  |.|||||  |.|||||||||||.|.
Sbjct 1404  GGAACCATGGCTTGTTGACTTCTTTGCCCCTTGGTGTCCGCCATGTCGTGCGCTTT--TGCCAGAGTTACGGAA  1475

Query 1476  AGCATCAAATCTTCTTTATGGTCAGCTTAAGTTTGGTACACTAGATTGTACAGTTCATGAGGGACTCTGTAACA  1549
            ||||||||..||.||.||.|||||.||.||..|||||||..||||.||||||.|||||||.||||||||.||||
Sbjct 1476  AGCATCAACACTGCTCTACGGTCAACTCAAAGTTGGTACCTTAGACTGTACAATTCATGAAGGACTCTGCAACA  1549

Query 1550  TGTATAACATTCAGGCTTATCCAACAACAGTGGTATTCAACCAGTCCAACATTCATGAGTATGAAGGACATCAC  1623
            ||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  TGTATAACATCCAAGCTTATCCAACGACAGTGGTATTCAATCAGTCCAGTATTCATGAGTATGAAGGACATCAC  1623

Query 1624  TCTGCTGAACAAATCTTGGAGTTCATAGAGGATCTTATGAATCCTTCAGTGGTCTCCCTTACACCCACCACCTT  1697
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|..||.||||||||||||||.||||||||||.|||.||
Sbjct 1624  TCTGCGGAACAGATCTTGGAGTTCATAGAGGATCTCAGAAACCCTTCAGTGGTCTCTCTTACACCCAGCACTTT  1697

Query 1698  CAACGAACTAGTTACACAAAGAAAACACAACGAAGTCTGGATGGTTGATTTCTATTCTCCGTGGTGTCATCCTT  1771
            |||.||.||.||||.|||.|||||.||..|.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1698  CAATGAGCTGGTTAAACAGAGAAAGCATGATGAAGTCTGGATGGTCGATTTCTATTCTCCATGGTGTCATCCCT  1771

Query 1772  GCCAAGTCTTAATGCCAGAATGGAAAAGAATGGCCCGGACATTAACTGGACTGATCAACGTGGGCAGTATAGAT  1845
            |.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||.
Sbjct 1772  GTCAGGTCTTGATGCCAGAATGGAAACGCATGGCCCGGACGTTAACTGGACTGATCAATGTAGGCAGTGTGGAC  1845

Query 1846  TGCCAACAGTATCATTCTTTTTGTGCCCAGGAAAACGTTCAAAGATACCCTGAGATAAGATTTTTTCCCCCAAA  1919
            ||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1846  TGCCAACAGTATCATTCTTTTTGTACTCAAGAAAATGTTCAAAGATACCCCGAGATAAGATTTTATCCCCAAAA  1919

Query 1920  ATCAAATAAAGCTTATCAGTATCACAGTTACAATGGTTGGAATAGGGATGCTTATTCCCTGAGAATCTGGGGTC  1993
            .||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 1920  GTCAAGTAAAGCCTATCAGTATCATAGTTACAATGGCTGGAATAGGGATGCGTATTCCCTGAGAAGCTGGGGTC  1993

Query 1994  TAGGATTTTTACCTCAAGTATCCACAGATCTAACACCTCAGACTTTCAGTGAAAAAGTTCTACAAGGGAAAAAT  2067
            |.||||||||.||.||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1994  TTGGATTTTTGCCCCAAGCATCCATAGATTTAACACCTCAGACTTTCAATGAAAAAGTTCTACAAGGGAAAACT  2067

Query 2068  CATTGGGTGATTGATTTCTATGCTCCTTGGTGTGGACCTTGCCAGAATTTTGCTCCAGAATTTGAGCTCTTGGC  2141
            ||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2068  CACTGGGTGGTTGATTTCTATGCTCCTTGGTGTGGACCTTGCCAGAATTTTGCTCCTGAGTTTGAACTCTTGGC  2141

Query 2142  TAGGATGATTAAAGGAAAAGTGAAAGCTGGAAAAGTAGACTGTCAGGCTTATGCTCAGACATGCCAGAAAGCTG  2215
            |||||||||.|||||||||||||.|||.||.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 2142  TAGGATGATCAAAGGAAAAGTGAGAGCCGGGAAAGTGGACTGTCAGGCTTACCCCCAGACGTGCCAGAAAGCCG  2215

Query 2216  GGATCAGGGCCTATCCAACTGTTAAGTTTTATTTCTACGAAAGAGCAAAGAGAAATTTTCAAGAAGAGCAGATA  2289
            |.||||..|||||.||.|.|||.||..|.||....|||||.||||||||||.||.|.||...||||||||.|||
Sbjct 2216  GCATCAAAGCCTACCCCAGTGTCAAACTGTACCAGTACGAGAGAGCAAAGAAAAGTATTTGGGAAGAGCAAATA  2289

Query 2290  AATACCAGAGATGCAAAAGCAATCGCTGCCTTAATAAGTGAAAAATTGGAAACTCTCCGAAATCAAGGCAAGAG  2363
            |||.||||||||||||||.|.||.|||||||||||...||.||||||||||||.||||.||..||||..||.||
Sbjct 2290  AATTCCAGAGATGCAAAAACTATTGCTGCCTTAATTTATGGAAAATTGGAAACGCTCCAAAGCCAAGTAAAAAG  2363

Query 2364  GAATAAGGATGAACTT  2379
            .|||||||||||.|||
Sbjct 2364  AAATAAGGATGAGCTT  2379