Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15877
• Subject: XM_017006705.1
• Aligned Length: 1566
• Identities: 1498
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74

Query   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148

Query  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCGCCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCACCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG  222

Query  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296

Query  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370

Query  371  TCTCCACAGCT---------------------------------------------GCCAACACTGGACAAATT  399
            |||||||||||                                             ||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCCACAGCTGTAAGTGGACACCTGGACATTCGAGGCGGCCACAACGTGAGGCAGGCCAACACTGGACAAATT  444

Query  400  GATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGG  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGG  518

Query  474  GCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGT  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGT  592

Query  548  TGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTG  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTG  666

Query  622  ATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCAT  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCAT  740

Query  696  CACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGG  814

Query  770  TCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATC  888

Query  844  CTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAAC  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAAC  962

Query  918  CGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGG  1036

Query  992  CCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAG  1110

Query 1066  AAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTT  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTT  1184

Query 1140  GCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCC  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCC  1258

Query 1214  AGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATG  1287
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  AGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATG  1332

Query 1288  GTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCT  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCT  1406

Query 1362  GCTCGGTTCAAGCTCCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCA  1435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTCGGTTCAAGCTCCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCA  1480

Query 1436  TACAACCCTTCATCTGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGT---------  1500
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct 1481  TACAACCCTTCATCTGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCA  1554

Query 1501  ------------  1500
                        
Sbjct 1555  AAAACCTCTATT  1566