Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15910
- Subject:
- NM_001352162.1
- Aligned Length:
- 1467
- Identities:
- 1293
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
Query 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
Query 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT 222
||||||||
Sbjct 149 TCACCACA------------------------------------------------------------------ 156
Query 223 GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA 296
Sbjct 157 -------------------------------------------------------------------------- 156
Query 297 CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 ----------------------------------GGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 196
Query 371 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 270
Query 445 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 344
Query 519 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 418
Query 593 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 492
Query 667 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 566
Query 741 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA 640
Query 815 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC 714
Query 889 CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT 788
Query 963 CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT 862
Query 1037 CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC 936
Query 1111 TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA 1010
Query 1185 CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC 1084
Query 1259 TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA 1158
Query 1333 GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT 1232
Query 1407 GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1467
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG 1293