Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15910
• Subject: NM_029098.3
• Aligned Length: 1467
• Identities: 1316
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAGCAGCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTGTTCCACGACAGGGTCCGCGAGTGCATCAT  74

Query   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148
            .||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148

Query  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTGGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTC  222

Query  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296
            ||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct  223  GCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGAGGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTA  296

Query  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACCTCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCC  370

Query  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444

Query  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCTTGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATC  518

Query  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592
            .||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  519  CGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACTTCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCT  592

Query  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666
            ||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  ACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACTCCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCT  666

Query  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740
            ||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGAGGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGA  740

Query  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814
            |||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  GGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAATCCCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACATGGAACTGCTGCATA  814

Query  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGAGAAGAGGCGGAAGGCTTCAGCCTGGCAACGGAAC  888
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||.|||.|.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTCCTCTTGGAAAAGCGTCGGAAGGCGTCAGCCTGGCAACGGAAC  888

Query  889  CTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTGCTCATTGTGGCCATCCACAT  962
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||
Sbjct  889  CTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGTCCTCATCGTGGCTGTCCACAT  962

Query  963  CCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCTCCTTAGGCCAGGTCTCCTTCT  1036
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||.|.|..||.|||||||||.||||||||
Sbjct  963  CCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTGCCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTGCCCTAGGCCAGGCCTCCTTCT  1036

Query 1037  CCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGC  1110
            ||||.|||||.||||||||.|||.||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037  CCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATCATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTGATGGTGTCCTCAGTGGTGGGT  1110

Query 1111  TTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAA  1184
            |||||.||||||||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  TTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAGCCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATCGATGACACAGATCATTGGGAA  1184

Query 1185  CTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACC  1258
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1185  CTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTCTTGGCCTGACACGCTTTGACC  1258

Query 1259  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCA  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  TGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCT  1332

Query 1333  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  GGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGAGCTGATCCGAGCCTTTGGGCT  1406

Query 1407  GGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1467
            ||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.||||||||||..|||||.||.
Sbjct 1407  GGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTGGGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGCAGCATCAA  1467