Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16064
• Subject: XM_011537333.2
• Aligned Length: 2277
• Identities: 2161
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAAAGCTGGAGTGACTGCCTCCGGAACGAAAAGGAAGTGGGAACTTCTCTGAAAGTGAAACTGCTTAGCCG  74

Query    1  -------------------------------------ATGCCATCACCACAGACAGACACTCCTGGGCCGGAGC  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCTGGGAACCTCAAGGAAGCTCTCCTGCTGCCAAGATGCCATCACCACAGACAGACACTCCTGGGCCGGAGC  148

Query   38  TGCAGAGTCCCAAGGAGGCTGAGGAGCCACAGACTCCAGCTCAGGGCTCCCGGCGAACAAGCAGCAGGAAAGAG  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCAGAGTCCCAAGGAGGCTGAGGAGCCACAGACTCCAGCTCAGGGCTCCCGGCGAACAAGCAGCAGGAAAGAG  222

Query  112  CCCAATGCCCACCGCAAGGATGGCACAAGGCTGGGCCTGGGCTCCCTGAGGCAGGCCTTCTCCCGGGCCAGCCA  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAATGCCCACCGCAAGGATGGCACAAGGCTGGGCCTGGGCTCCCTGAGGCAGGCCTTCTCCCGGGCCAGCCA  296

Query  186  GCGGGCTTTGACCCAGGTCTCCAAGGAAGATACGGGCCTGTTCCGGCGAAGCTCCTGCTCCCTGTTCCGGTCCT  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGGGCTTTGACCCAGGTCTCCAAGGAAGATACGGGCCTGTTCCGGCGAAGCTCCTGCTCCCTGTTCCGGTCCT  370

Query  260  TCCGGCAAGCCCTGAATGACGGCCCAGCTACCGGCCATTCCCAGGCCACTCCTGAGGTGCCCTCGGGGGTCATG  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCGGCAAGCCCTGAATGACGGCCCAGCTACCGGCCATTCCCAGGCCACTCCTGAGGTGCCCTCGGGGGTCATG  444

Query  334  AATGGTGTCAGCCAACAGGCATCCACTGGGGCAGCGTCTGAGGAACTGAAACCCGAGGCAGAAGGCAAATCCGT  407
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGGTGTCAGCCAGCAGGCATCCACTGGGGCAGCGTCTGAGGAACTGAAACCCGAGGCAGAAGGCAAATCCGT  518

Query  408  GGCCGACCTCATTACTGAACGGCAACTGCTGGCGGCCTTCGAACAGCTTCTGCGCCTGGAGACGCTGCTGGTGG  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGACCTCATTACTGAACGGCAACTGCTGGCGGCCTTCGAACAGCTTCTGCGCCTGGAGACGCTGCTGGTGG  592

Query  482  CCGAGAAGGCCTCGCGCACCTTTGAGCAGGACCCTACGGCCTTCGCGCGGCGCGCTATGGACGTGTGCCTGCTT  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGAGAAGGCCTCGCGCACCTTTGAGCAGGACCCTACGGCCTTCGCGCGGCGCGCTATGGACGTGTGCCTGCTT  666

Query  556  TACGACGGGCTGGCAGCCGAGATCGGCGCCATCGTGCGCGAGACGCTGGACAGCGACGGTGTGGACGCGGCCGC  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACGACGGGCTGGCAGCCGAGATCGGCGCCATCGTGCGCGAGACGCTGGACAGCGACGGTGTGGACGCGGCCGC  740

Query  630  GCTGGCCGAGCTGGCCCGCGTGGTGAGCGCGGAGGAGGAGGCCCACCCTTCTCCCCCCGACGACGGCGACTTCC  703
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGGCCGAGCTGGCCCGCGTGGTGAGCGCGGAGGAGGAAGCCCACCCTTCTCCCCCCGACGACGGCGACTTCC  814

Query  704  TGCGCACGCCGCGCCGCTGGCGCCAGCACTGGGAGGAGGCGGTGCGGCGAAGCGCTCAGGAGCGCGTGCGGCGG  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGCACGCCGCGCCGCTGGCGCCAGCACTGGGAGGAGGCGGTGCGGCGAAGCGCTCAGGAGCGCGTGCGGCGG  888

Query  778  CCGGGCGCGGGGTGGGCCTTCGGGGAGGCGGAGGGCGCGTCGGGTTTGGCCCAGCTTCTGGCCGAGCTGGGTGG  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGGGCGCGGGGTGGGCCTTCGGGGAGGCGGAGGGCGCGTCGGGTTTGGCCCAGCTTCTGGCCGAGCTGGGTGG  962

Query  852  CTTGGTTCGCCGCGACCTGCAGAAGGTGCGGCAGGAGGTGCAGCCCGCGTATGCGGCGGCCGGCTTCCCAGCGT  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGGTTCGCCGCGACCTGCAGAAGGTGCGGCAGGAGGTGCAGCCCGCGTATGCGGCGGCCGGCTTCCCAGCGT  1036

Query  926  GGGAGGTCTATCTGCGTGCCTTCCACAGCGCCGTGGCCCAGCGCCTCCAGGAGCTCGCGCGCGACGCCCGCGGC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGAGGTCTATCTGCGTGCCTTCCACAGCGCCGTGGCCCAGCGCCTCCAGGAGCTCGCGCGCGACGCCCGCGGC  1110

Query 1000  TGCGAGCAGCTCTATATCCTGCTGGACTGGGCCGCCAACGTCTACGGCAGTCCTGACTTCCTGGGCGCCCCGGG  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCGAGCAGCTCTATATCCTGCTGGACTGGGCCGCCAACGTCTACGGCAGTCCTGACTTCCTGGGCGCCCCGGG  1184

Query 1074  GCTGGCGCTGCCCGCCGAGCCGCTGCCTCCGCTCCTGGCGCCGGACGTGTGGGCCCGACTGGAGAGCGACTACA  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGCGCTGCCCGCCGAGCCGCTGCCTCCGCTCCTGGCGCCGGACGTGTGGGCCCGACTGGAGAGCGACTACA  1258

Query 1148  CCAGCTTCCTGGAGGCCAAGATCGCAAGCTGCTTCGACAGCATCTTGCAGCTGGAGCAGAGTCACTGGGCGGCC  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGCTTCCTGGAGGCCAAGATCGCAAGCTGCTTCGACAGCATCTTGCAGCTGGAGCAGAGTCACTGGGCGGCC  1332

Query 1222  GCCGAGGTCCCCGAGGTGCTGCAGGGCCTCTACCAGGCGCCGCTGTCCATGGACGTCCATATGCTCGTGGCCGA  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCGAGGTCCCCGAGGTGCTGCAGGGCCTCTACCAGGCGCCGCTGTCCATGGACGTCCATATGCTCGTGGCCGA  1406

Query 1296  GCACGTGAAGGCGGCCGGCGCCATCTCCGCGGAGCTGGAGGCCACCACCCTGCGAATCTGCACGCGGGCGCTCG  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCACGTGAAGGCGGCCGGCGCCATCTCCGCGGAGCTGGAGGCCACCACCCTGCGAATCTGCACGCGGGCGCTCG  1480

Query 1370  GCCTCTTCGTGCCCAGGTTTGAAAAGGCTTTTCTGGCGTCGGAGGCGGTGAGCGAGCCGCACCTGGGCGCCTAC  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCTCTTCGTGCCCAGGTTTGAAAAGGCTTTTCTGGCGTCGGAGGCGGTGAGCGAGCCGCACCTGGGCGCCTAC  1554

Query 1444  ATCAACGCCTGCGAGGAGCTCAGGACCAGTCTTCTCTCCAGGTTCCCAGGAACCCAAGAGGAGCTGGAGAAGCC  1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCAACGCCTGCGAGGAGCTCAGGACCAGTCTTCTCTCCAGGTTCCCAGGAACCCAAGAGGAGCTGGAGAAGCC  1628

Query 1518  CCTGGTGACGGCCACCTGCAGCTTCCAGAAGCACTTGCTTCAGGGCTTGCAGCGTGAGTTGCAGCCGCTCTTCA  1591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTGGTGACGGCCACCTGCAGCTTCCAGAAGCACTTGCTTCAGGGCTTGCAGCGTGAGTTGCAGCCGCTCTTCA  1702

Query 1592  GGGTTGTGTGCACCAGGGACTGGCTGACGCAGGACTGGCTGCATCCCCTCATGGACAAGGTGGTGACCTTCGCC  1665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGGTTGTGTGCACCAGGGACTGGCTGACGCAGGACTGGCTGCATCCCCTCATGGACAAGGTGGTGACCTTCGCC  1776

Query 1666  GGTCATCTCCAGCGTGTGGCCCGGCCGCGGGCACAGGAGACTCTGCAGGAGGTGCACCGGTTCGTGGTCCGCGA  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTCATCTCCAGCGTGTGGCCCGGCCGCGGGCACAGGAGACTCTGCAGGAGGTGCACCGGTTCGTGGTCCGCGA  1850

Query 1740  GTACCTGGCGCGGGCGCTGAGGCCACGGGAGCGGTTCCGGGGCATGGAGCGCATGCATGGCTCCCAGAAGATGA  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTACCTGGCGCGGGCGCTGAGGCCACGGGAGCGGTTCCGGGGCATGGAGCGCATGCATGGCTCCCAGAAGATGA  1924

Query 1814  GCCTGGATGCCCAGGCCATCAGCGACACCTTCCAGGGCCTGGGTTCCGAGGCCACATGGTTGGACCAAGCCATC  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCTGGATGCCCAGGCCATCAGCGACACCTTCCAGGGCCTGGGTTCCGAGGCCACATGGTTGGACCAAGCCATC  1998

Query 1888  CAGTGCGTGGCTGAGATCCTGGGCGAGACCTACAAAGATGACATCCAGCGGCACCTGGAGACTCTTATCCGGAG  1961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGTGCGTGGCTGAGATCCTGGGCGAGACCTACAAAGATGACATCCAGCGGCACCTGGAGACTCTTATCCGGAG  2072

Query 1962  CTACCCCGACATCAGGCGGGACCACATACTGGCCATTCTGGCGCTGCGCCGACTGGGCCGCCGGCGGAACCAGC  2035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2073  CTACCCCGACATCAGGCGGGACCACATACTGGCCATTCTGGCGCTGCGCCGACTGGGCCGCCAGCGGAACCAGC  2146

Query 2036  ATCTCTTGCAGCACACCGAAGACCTGCTGAGAGCTGCGGCCGGGGCGGCGGGTGCGGAGGCCCCTCGGGGCCGC  2109
            ||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATCTCTTGCAGCACACTCAAGACCTGCTGAGAGCTGCGGCCGGGGCGGCGGGTGCGGAGGCCCCTCGGGGCCGC  2220

Query 2110  GTGCTCTTCGAGGAGATCAAGGTGCCCAGTGCCATGGCTGTGCTGATCACCTGCGTC  2166
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTGCTCTTCGAGGAGATCAAGGTGCCCAGTGCCATGGCTGTGCTGATCACCTGCGTC  2277