Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_16068
- Subject:
- NM_001363145.1
- Aligned Length:
- 1618
- Identities:
- 1307
- Gaps:
- 305
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 1 ATGGCGGCGGAGCAGGACCCCGAGGCGCGCGCGGCGGCGCGGCCGCTGCTCACTGACCTCTACCAGGCCACCAT 74
Query 3 GGCGTTGGGCTATTGGCGCGCGGGCCGGGCGCGGGACGCCGCCGAGTTCGAGCTCTTCTTCCGCCGCTGCCCGT 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCGTTGGGCTATTGGCGCGCGGGCCGGGCGCGGGACGCCGCCGAGTTCGAGCTCTTCTTCCGCCGCTGCCCGT 148
Query 77 TCGGCGGCGCCTTCGCCTTGGCCGCCGGCTTGCGCGACTGTGTGCGCTTCCTGCGCGCCTTCCGCCTGCGGGAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCGGCGGCGCCTTCGCCTTGGCCGCCGGCTTGCGCGACTGTGTGCGCTTCCTGCGCGCCTTCCGCCTGCGGGAC 222
Query 151 GCCGACGTGCAGTTCCTGGCCTCGGTGCTGCCCCCAGACACGGATCCTGCGTTCTTCGAGCACCTTCGGGCCCT 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGACGTGCAGTTCCTGGCCTCGGTGCTGCCCCCAGACACGGATCCTGCGTTCTTCGAGCACCTTCGGGCCCT 296
Query 225 CGACTGCTCCGAGGTGACGGTGCGAGCCCTGCCCGAGGGCTCCCTCGCCTTCCCCGGAGTGCCGCTCCTGCAGG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGACTGCTCCGAGGTGACGGTGCGAGCCCTGCCCGAGGGCTCCCTCGCCTTCCCCGGAGTGCCGCTCCTGCAGG 370
Query 299 TGTCCGGGCCGCTCCTGGTGGTGCAGCTGCTGGAGACACCGCTGCTCTGCCTGGTCAGCTACGCCAGCCTGGTG 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTCCGGGCCGCTCCTGGTGGTGCAGCTGCTGGAGACACCGCTGCTCTGCCTGGTCAGCTACGCCAGCCTGGTG 444
Query 373 GCCACCAACGCAGCGCGGCTTCGCTTGATCGCAGGGCCAGAGAAGCGGCTGCTAGAGATGGGCCTGAGGCGGGC 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCACCAACGCAGCGCGGCTTCGCTTGATCGCAGGGCCAGAGAAGCGGCTGCTAGAGATGGGCCTGAGGCGGGC 518
Query 447 TCAGGGCCCCGATGGGGGCCTGACAGCCTCCACCTACAGCTACCTGGGCGGCTTCGACAGCAGCAGCAACGTGC 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGGGCCCCGATGGGGGCCTGACAGCCTCCACCTACAGCTACCTGGGCGGCTTCGACAGCAGCAGCAACGTGC 592
Query 521 TAGCGGGCCAGCTGCGAGGTGTGCCGGTGGCCGGGACCCTGGCCCACTCCTTCGTCACTTCCTTTTCAGGCAGC 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGCGGGCCAGCTGCGAGGTGTGCCGGTGGCCGGGACCCTGGCCCACTCCTTCGTCACTTCCTTTTCAGGCAGC 666
Query 595 GAGGTGCCCCCTGACCCGATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCA 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGTGCCCCCTGACCCGATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCA 740
Query 669 GGTGTGGCTGGAGCAGGTGTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCT 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGTGGCTGGAGCAGGTGTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCT 814
Query 743 TTGTGGCCTATGCCTTGGCTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGT 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTGGCCTATGCCTTGGCTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGT 888
Query 817 CTCCCCAACTTCCTAGCAGTCGCCTTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAG 890
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTCCCCAACTTCCTAGCAGTCGCCCTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAG 962
Query 891 TGGTGACCTGCTACAGCAGGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCT 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGTGACCTGCTACAGCAGGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCT 1036
Query 965 GGCTGGAGTCAGTCCTCATCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGC 1038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCTGGAGTCAGTCCTCATCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGG----- 1105
Query 1039 AGTGAGGTGAATGTCATTGGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTA 1112
Sbjct 1106 -------------------------------------------------------------------------- 1105
Query 1113 TAAGCTGGTGGCCGTGGGGGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGA 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 --AGCTGGTGGCCGTGGGGGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGA 1177
Query 1187 GCAAGGCTGCTTTCCGGCTCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 GCAAGGCTGCTTTCCGGCTCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCA 1251
Query 1261 GTGCCACAGGCTGGGCAGGAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCA 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GTGCCACAGGCTGGGCAGGAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCA 1325
Query 1335 GGTGGAGCCACTACTGCGGCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGGTGGCTGCCCCA-CCGCCCTCATCC--------- 1398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|| | ||||.|.|||||
Sbjct 1326 GGTGGAGCCACTACTGCGGCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTG----AGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAG 1395
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1396 TCTAGAGCCTTGGCCCAGCTGTCCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTA 1469
Query 1399 ---------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1470 CCAGGTGGTGCTGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCC 1533