Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_16073
Subject:
NM_001102575.2
Aligned Length:
1872
Identities:
1870
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA  74
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Sbjct    1  ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA  74

Query   75  GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC  148
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Sbjct   75  GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC  148

Query  149  TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC  222
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Sbjct  149  TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC  222

Query  223  CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCCGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC  296
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Sbjct  223  CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCTGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC  296

Query  297  GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG  370
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Sbjct  297  GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG  370

Query  371  CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA  444
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Sbjct  371  CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA  444

Query  445  GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG  518
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Sbjct  445  GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG  518

Query  519  CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC  592
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Sbjct  519  CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC  592

Query  593  GCTCCGACCTGTCCCTGGGCTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG  666
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Sbjct  593  GCTCCGACCTGTCCCTGGGTTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG  666

Query  667  GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA  740
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Sbjct  667  GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA  740

Query  741  GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA  814
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Sbjct  741  GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA  814

Query  815  ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC  888
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Sbjct  815  ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC  888

Query  889  TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC  962
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Sbjct  889  TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC  962

Query  963  GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG  1036
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Sbjct  963  GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG  1036

Query 1037  AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG  1110
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Sbjct 1037  AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG  1110

Query 1111  CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG  1184
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Sbjct 1111  CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG  1184

Query 1185  GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG  1258
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Sbjct 1185  GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG  1258

Query 1259  ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG  1332
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Sbjct 1259  ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG  1332

Query 1333  CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA  1406
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Sbjct 1333  CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA  1406

Query 1407  GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG  1480
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Sbjct 1407  GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG  1480

Query 1481  CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC  1554
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Sbjct 1481  CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC  1554

Query 1555  ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGGAGCTCT  1628
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Sbjct 1555  ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGGAGCTCT  1628

Query 1629  TACCAAAGTCAAGGAGAGTAGGCGACACGTGGAGGAAGGGAAGATGGAGGTGCAGAAGGCTGACGGCATTCAGG  1702
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Sbjct 1629  TACCAAAGTCAAGGAGAGTAGGCGACACGTGGAGGAAGGGAAGATGGAGGTGCAGAAGGCTGACGGCATTCAGG  1702

Query 1703  ATCGCTGTAACACTATTTCTTTTGCCACTTTGGCTGAAATTCACCACTTCCATCAAATTCGAGTGAGAGACTTT  1776
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Sbjct 1703  ATCGCTGTAACACTATTTCTTTTGCCACTTTGGCTGAAATTCACCACTTCCATCAAATTCGAGTGAGAGACTTT  1776

Query 1777  AAATCACAGATGCAGCATTTCTTACAACAACAAATAATATTTTTCCAAAAAGTTACCCAGAAGTTGGAAGAAGC  1850
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Sbjct 1777  AAATCACAGATGCAGCATTTCTTACAACAACAAATAATATTTTTCCAAAAAGTTACCCAGAAGTTGGAAGAAGC  1850

Query 1851  TCTTCACAAATATGATAGTGTT  1872
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Sbjct 1851  TCTTCACAAATATGATAGTGTT  1872