Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16073
• Subject: NM_001145427.2
• Aligned Length: 1898
• Identities: 1718
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA  74
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Sbjct    1  ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA  74

Query   75  GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC  148

Query  149  TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC  222

Query  223  CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCCGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCTGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC  296

Query  297  GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG  370
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Sbjct  297  GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG  370

Query  371  CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA  444
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Sbjct  371  CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA  444

Query  445  GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG  518
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Sbjct  445  GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG  518

Query  519  CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC  592
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Sbjct  519  CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC  592

Query  593  GCTCCGACCTGTCCCTGGGCTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG  666
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Sbjct  593  GCTCCGACCTGTCCCTGGGTTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG  666

Query  667  GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA  740
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Sbjct  667  GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA  740

Query  741  GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA  814
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Sbjct  741  GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA  814

Query  815  ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC  888
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Sbjct  815  ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC  888

Query  889  TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC  962
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Sbjct  889  TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC  962

Query  963  GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG  1036
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Sbjct  963  GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG  1036

Query 1037  AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG  1110
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Sbjct 1037  AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG  1110

Query 1111  CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG  1184
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Sbjct 1111  CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG  1184

Query 1185  GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG  1258
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Sbjct 1185  GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG  1258

Query 1259  ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG  1332
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Sbjct 1259  ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG  1332

Query 1333  CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA  1406
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Sbjct 1333  CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA  1406

Query 1407  GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG  1480
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Sbjct 1407  GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG  1480

Query 1481  CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC  1554
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Sbjct 1481  CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC  1554

Query 1555  ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGG------  1622
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Sbjct 1555  ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGGTAAAGC  1628

Query 1623  --AGCTCTTACCAAAGTCAAGGAGAGTAGGCGACACGTGGAGGAAGGGAAGATGGA-GGTGCAGAAGGCTGA--  1691
              .||.|||             ||||.|||.||.|  |||||          ||.| .||||   |||||||  
Sbjct 1629  CTGGCCCTT-------------AGAGCAGGTGATA--TGGAG----------TGTATTGTGC---AGGCTGAAA  1674

Query 1692  ----CGGCATTCAGGATCGCTGTAACACTATTTCTTTTGCCACTTTGGCTGAAATTCACCACTTCCATCAAATT  1761
                ||.|.||   ||..||.|||               |||||.|||.|    ||||      ..||||.|||
Sbjct 1675  GGGGCGACTTT---GACAGCAGTA---------------CCACTGTGGGT----TTCA------GAATCATATT  1720

Query 1762  CGA---GTGAGAGACTTTAA---ATCACAGA--TGCA-GCAT--TTCTTACAACAACAAATAATATTTTTCCAA  1824
            |.|   |||||      .||   |.||.|||  ||.| ||.|  .||                   ||||||..
Sbjct 1721  CTACAGGTGAG------GAAGCGAGCAGAGACGTGGACGCCTGGGTC-------------------TTTTCCCT  1769

Query 1825  AAAGTTACCCAGAAGTTGGAAGAAGCTCTTCACAAATATGATAGTGTT  1872
            |.||                                            
Sbjct 1770  AGAG--------------------------------------------  1773