Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16124
• Subject: NM_001290342.2
• Aligned Length: 1149
• Identities: 1144
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATTCTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATTCTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCT  74

Query   75  TGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATTTATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATTTATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGC  148

Query  149  TGATTATCAGGCGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCTCTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTT  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATTATCAGACGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCTCTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTT  222

Query  223  CGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAAACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAAACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATAT  296

Query  297  TTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGGTGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGGTGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAG  370

Query  371  AGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGGAGATTTGCATTTTACT---TGATCACTGTTGCT  441
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGGAGATTTGCATTTTACTTAATGATCACTGTTGCT  444

Query  442  GGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTTATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCC  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTTATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCC  518

Query  516  CCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGAGTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGAGTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCT  592

Query  590  TTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCACCACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCACCACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCT  666

Query  664  TGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGATTGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGATTGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTC  740

Query  738  TGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTAACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTT  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTAACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTT  814

Query  812  TCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATATTGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATATTGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAG  888

Query  886  CCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGATCTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGATCTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTA  962

Query  960  CATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCATCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCATCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATG  1036

Query 1034  AAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGCAAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCGGG  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1037  AAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGCAAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCAGG  1110

Query 1108  GCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1146
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1149