Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: NM_001288748.2
• Aligned Length: 1819
• Identities: 1624
• Gaps: 194

Alignment

Query    1  ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGC  74

Query   75  GGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGC  148

Query  149  TGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCT  222

Query  223  TTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGA  296

Query  297  CTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCAGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCAGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGG  370

Query  371  AGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATG  444

Query  445  CTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCC  518

Query  519  CAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATT  592

Query  593  ACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGAT  666

Query  667  GAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCT  740

Query  741  CAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAA  814

Query  815  GGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGTAGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGTAGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAG  888

Query  889  ACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTA  962

Query  963  CTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGC  1036

Query 1037  CCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGG  1110

Query 1111  CTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCT  1184

Query 1185  GAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACCCTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGC  1258
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGGACACTGTTGACCCAAAACTGGTGACCCTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGC  1258

Query 1259  CTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAACTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAACTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCT  1332

Query 1333  ACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTC  1406

Query 1407  GGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||
Sbjct 1407  GGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAG-------GCACTGT  1473

Query 1481  TTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  TTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGA  1547

Query 1555  GATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATGGACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  GATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATGGACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGA  1621

Query 1629  AGAC----------------------------------------------------------------------  1632
            ||||                                                                      
Sbjct 1622  AGACTGAACTGTTGGCAGAGAGAAGCTGGTGGAGTCCTGTGGCTTTCCAGAGAAGCCAGGAGCCAAAAGCTGGG  1695

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1696  GTAGGAGAGGAGAAAGCAGAGCAGCCTCCTGGAAGAAGGCCTTGTCAGCTTTGTCTGTGCCTCGCAAATCAGAG  1769

Query 1633  -------------------------------------------  1632
                                                       
Sbjct 1770  GCAAGGGAGAGGTTGTTACCAGGGGACACTGAGAATGTACATT  1812