Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: NM_177161.4
• Aligned Length: 1643
• Identities: 1441
• Gaps: 28

Alignment

Query    1  ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGC  74
            |||||.||.|||||||||||   |||.|||||||||.||||||||||||||   ||||||||      .||.||
Sbjct    1  ATGGGCCCAGGGGCGCGGCT---GGCTCTGCTGGCGCTGCTGGCGCTCGGG---GGAGACCC------CGCGGC  62

Query   75  GG-CTCGGGGC-----GACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGC  142
            || |.||||||     |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   63  GGCCACGGGGCGGGAGGACACGTTCTCCGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCAGGCTGC  136

Query  143  TGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTA  216
            |||||...||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  137  TGGGGACACTGAGGCGCTACCTGCGCGGCGAGGAGGCGCGGCTGCGCGACTTGACCAGATTCTATGACAAGGTA  210

Query  217  CTTTCTTTGCATGAGGA-TTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGC  289
            |||||||||||.||||| ||.|| .|.||||||.|..||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  211  CTTTCTTTGCACGAGGACTTGAA-GATCCCTGTAGTGAATCCTCTACTTGCCTTCACTCTCATCAAACGTCTGC  283

Query  290  AGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCAGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAG  363
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  AGTCCGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCACTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAG  357

Query  364  AAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGT  437
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  358  AAGGTAGAGCAAGACCTTCCTGCCTTTGAGGACCTCGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGATGT  431

Query  438  GTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGT  511
            ||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||..|||||||.|||||||
Sbjct  432  GTACATGCTCAACGTGAAGGGCTTGGCTCGAGGCGTCTTCCAGAGGGTCACGGGCTCCTCCATCACCGACCTGT  505

Query  512  ACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGG  585
            ||||.||||..|.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct  506  ACAGTCCCAGGCAGCTCTTCTCTCTCACAGCGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACACAGGG  579

Query  586  GATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGAC  659
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..||.|..||||.|||||||||||
Sbjct  580  GATTACTACCATGCCATCCCATGGCTGGAGGAAGCTGTCAGTCTCTTCCGGAGAGCCCACGGCGAGTGGAAGAC  653

Query  660  AGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGT  733
            ||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||||.|||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||.|
Sbjct  654  AGAGGACGAGGCCAGTCTGGAAGACGCCCTGGATTACTTGGCCTTTGCCTGTTTCCAGGTAGGAAATGTTTCAT  727

Query  734  GTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAA  807
            |||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  728  GTGCCCTCAGCCTCTCTCGAGAGTTCCTTGTCTACAGCCCAGACAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTGTTGAAA  801

Query  808  TATGAAAGGCTCTTGGCAGAGA---GCCCCAACCACGTGGTAGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACC  878
            |||||||||||||||||.||||   |.|   ||||..|||..||||||.|||..||.|||||||||||..||||
Sbjct  802  TATGAAAGGCTCTTGGCTGAGAATGGTC---ACCAGATGGCGGCTGAGACTGCAATTCAGAGGCCCAACGTACC  872

Query  879  CCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCC  952
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|.||||||.||||
Sbjct  873  CCACCTGCAGACCAGGGACACCTACGAGGGGCTATGCCAGACCCTGGGCTCCCAGCCAACACACTACCAAATCC  946

Query  953  CTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATC  1026
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||||...|||.||||||||..||
Sbjct  947  CCAGCCTCTACTGCTCCTATGAGACCAATTCCAGCCCCTACCTACTGCTCCAGCCTGCCCGAAAGGAGGTTGTC  1020

Query 1027  CACCTGGAGCC-CTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTG  1099
            |||||...||| || |||.|||||||||||||||||.|||||||||...||.|||||||||||..||||.||||
Sbjct 1021  CACCTACGGCCGCT-CATAGCTCTCTACCATGACTTTGTCAGTGACGAGGAAGCTCAGAAAATCCGAGAGCTTG  1093

Query 1100  CAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAA  1173
            |||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  CAGAACCGTGGCTCCAGAGATCAGTGGTGGCTTCGGGGGAAAAGCAGTTGCAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAA  1167

Query 1174  AGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACCCTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCT  1247
            |||||||||||.||||||||.|||.|.||||..|||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1168  AGTGCCTGGCTAAAGGACACGGTTGATCCAATGCTGGTGACCCTTGACCACCGCATTGCGGCCCTCACAGGCCT  1241

Query 1248  TGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAACTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACT  1321
            |||..|||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1242  TGACATCCAGCCTCCCTACGCAGAGTATCTCCAGGTGGTGAACTATGGAATCGGAGGGCACTATGAGCCTCACT  1315

Query 1322  TTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATC  1395
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1316  TTGACCATGCTACGTCGCCCAGCAGCCCCCTGTACAGAATGAAGTCTGGGAACCGAGTGGCAACGTTTATGATC  1389

Query 1396  TATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAA  1469
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||.||||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1390  TATCTGAGCTCCGTAGAAGCTGGAGGAGCCACGGCTTTTATCTATGGCAACTTCAGTGTGCCTGTGGTTAAGAA  1463

Query 1470  TGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTG  1543
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464  TGCTGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGCGGAGAGGGGGATGGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTG  1537

Query 1544  TCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATGGACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGC  1617
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1538  TGCTGGTGGGAGACAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATCCACGAGTATGGACAGGAATTCCGAAGACCCTGCAGC  1611

Query 1618  TCCAGCCCTGAAGAC  1632
            .|||.||||||||||
Sbjct 1612  ACCAACCCTGAAGAC  1626