Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: NR_110031.2
• Aligned Length: 2255
• Identities: 1438
• Gaps: 817

Alignment

Query    1  -----------------------------ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCG  45
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GTCTGAGGGGAAGTTCGCGAGCGCTGGCTATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCG  74

Query   46  CTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGC  119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGC  148

Query  120  CCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACC  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACC  222

Query  194  TGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCA  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCA  296

Query  268  TTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCAGTGAGAACATCCG  341
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  297  TTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGT---------------------------------  337

Query  342  AGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGG  415
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  -GCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGG  410

Query  416  CCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACT  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  411  CCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACT  484

Query  490  GGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGG  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  485  GGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGG  558

Query  564  CAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTTCCGAG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  559  CAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTTCCGAG  632

Query  638  GATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTGCTTAT  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTGCTTAT  706

Query  712  TTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAATAAGAG  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  TTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAATAAGAG  780

Query  786  GATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGTAGCTGAGGCTGTCA  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  GATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGTAGCTGAGGCTGTCA  854

Query  860  TCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGGGTTCCCAG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  TCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGGGTTCCCAG  928

Query  934  CCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTGCTCCAGCC  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  CCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTGCTCCAGCC  1002

Query 1008  CATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACTCAGAGGCTC  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  CATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACTCAGAGGCTC  1076

Query 1082  AGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAGTTACAAGTG  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  AGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAGTTACAAGTG  1150

Query 1156  GAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACCCTCAACCACCGCAT  1229
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct 1151  GAGTACCGCATCAGCAAAA-------------------------------------------------------  1169

Query 1230  TGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAACTATGGCATCGGAG  1303
                                                                                      
Sbjct 1170  --------------------------------------------------------------------------  1169

Query 1304  GACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCAGGAAACCGA  1377
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  -------------------------------GTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCAGGAAACCGA  1212

Query 1378  GTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGCCAACCTCAG  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGCCAACCTCAG  1286

Query 1452  CGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACAGTGACACAC  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  CGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACAGTGACACAC  1360

Query 1526  TTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATGGACAGGAA  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATGGACAGGAA  1434

Query 1600  TTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGAC-----------------------------------------  1632
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 1435  TTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGACTGAACTGTTGGCAGAGAGAAGCTGGTGGAGTCCTGTGGCTT  1508

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1509  TCCAGAGAAGCCAGGAGCCAAAAGCTGGGGTAGGAGAGGAGAAAGCAGAGCAGCCTCCTGGAAGAAGGCCTTGT  1582

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1583  CAGCTTTGTCTGTGCCTCGCAAATCAGAGGCAAGGGAGAGGTTGTTACCAGGGGACACTGAGAATGTACATTTG  1656

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1657  ATCTGCCCCAGCCACGGAAGTCAGAGTAGGATGCACAGTACAAAGGAGGGGGGAGTGGAGGCCTGAGAGGGAAG  1730

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1731  TTTCTGGAGTTCAGATACTCTCTGTTGGGAACAGGACATCTCAACAGTCTCAGGTTCGATCAGTGGGTCTTTTG  1804

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1805  GCACTTTGAACCTTGACCACAGGGACCAAGAAGTGGCAATGAGGACACCTGCAGGAGGGGCTAGCCTGACTCCC  1878

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1879  AGAACTTTAAGACTTTCTCCCCACTGCCTTCTGCTGCAGCCCAAGCAGGGAGTGTCCCCCTCCCAGAAGCATAT  1952

Query 1633  --------------------------------------------------------------------------  1632
                                                                                      
Sbjct 1953  CCCAGATGAGTGGTACATTATATAAGGATTTTTTTTAAGTTGAAAACAACTTTCTTTTCTTTTTGTATGATGGT  2026

Query 1633  -----------------------------------  1632
                                               
Sbjct 2027  TTTTTAACACAGTCATTAAAAATGTTTATAAATCA  2061