Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: XM_006507944.3
• Aligned Length: 1670
• Identities: 1441
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGCTGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGC  74
            |||||.||.|||||||||||   |||.|||||||||.||||||||||||||   ||||||||      .||.||
Sbjct    1  ATGGGCCCAGGGGCGCGGCT---GGCTCTGCTGGCGCTGCTGGCGCTCGGG---GGAGACCC------CGCGGC  62

Query   75  GG-CTCGGGGC-----GACACGTTCTCGGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGC  142
            || |.||||||     |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   63  GGCCACGGGGCGGGAGGACACGTTCTCCGCGCTGACCAGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCAGGCTGC  136

Query  143  TGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGCGCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTA  216
            |||||...||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  137  TGGGGACACTGAGGCGCTACCTGCGCGGCGAGGAGGCGCGGCTGCGCGACTTGACCAGATTCTATGACAAGGTA  210

Query  217  CTTTCTTTGCATGAGGA-TTCAACAACCCCTGTGGCTAACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGC  289
            |||||||||||.||||| ||.|| .|.||||||.|..||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  211  CTTTCTTTGCACGAGGACTTGAA-GATCCCTGTAGTGAATCCTCTACTTGCCTTCACTCTCATCAAACGTCTGC  283

Query  290  AGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCAGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAG  363
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  AGTCCGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCCACTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAG  357

Query  364  AAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGT  437
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  358  AAGGTAGAGCAAGACCTTCCTGCCTTTGAGGACCTCGAGGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGATGT  431

Query  438  GTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCTTTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGT  511
            ||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||..|||||||.|||||||
Sbjct  432  GTACATGCTCAACGTGAAGGGCTTGGCTCGAGGCGTCTTCCAGAGGGTCACGGGCTCCTCCATCACCGACCTGT  505

Query  512  ACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCA--------------------  565
            ||||.||||..|.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  506  ACAGTCCCAGGCAGCTCTTCTCTCTCACAGCGGATGACTGCTTCCAAGTTGGCAAGCCCAGCTGTGGCTCGCGT  579

Query  566  -------AGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGTCAGTCTCTT  632
                   |||||||||||||||..||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  580  TCCCTGCAGGTGGCCTATGACACAGGGGATTACTACCATGCCATCCCATGGCTGGAGGAAGCTGTCAGTCTCTT  653

Query  633  CCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACTTGGCCTTTG  706
            |||..||.|..||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||||.||||||||||||
Sbjct  654  CCGGAGAGCCCACGGCGAGTGGAAGACAGAGGACGAGGCCAGTCTGGAAGACGCCCTGGATTACTTGGCCTTTG  727

Query  707  CTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGCCCAGATAAT  780
            |.|.|||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.|||
Sbjct  728  CCTGTTTCCAGGTAGGAAATGTTTCATGTGCCCTCAGCCTCTCTCGAGAGTTCCTTGTCTACAGCCCAGACAAT  801

Query  781  AAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGA---GCCCCAACCACGTGGTAGCTGA  851
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||   |.|   ||||..|||..|||||
Sbjct  802  AAGAGGATGGCCAGGAATGTGTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCTGAGAATGGTC---ACCAGATGGCGGCTGA  872

Query  852  GGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGACCCTGG  925
            |.|||..||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  873  GACTGCAATTCAGAGGCCCAACGTACCCCACCTGCAGACCAGGGACACCTACGAGGGGCTATGCCAGACCCTGG  946

Query  926  GTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTACCTGCTG  999
            |.||||||||.||.|.||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||.|||
Sbjct  947  GCTCCCAGCCAACACACTACCAAATCCCCAGCCTCTACTGCTCCTATGAGACCAATTCCAGCCCCTACCTACTG  1020

Query 1000  CTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCC-CTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAGTGACT  1072
            ||||||||...|||.||||||||..|||||||...||| || |||.|||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1021  CTCCAGCCTGCCCGAAAGGAGGTTGTCCACCTACGGCCGCT-CATAGCTCTCTACCATGACTTTGTCAGTGACG  1093

Query 1073  CAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGAAGCAG  1146
            ..||.|||||||||||..||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1094  AGGAAGCTCAGAAAATCCGAGAGCTTGCAGAACCGTGGCTCCAGAGATCAGTGGTGGCTTCGGGGGAAAAGCAG  1167

Query 1147  TTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACCCTCAA  1220
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.||||..|||||||||||..|
Sbjct 1168  TTGCAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTAAAGGACACGGTTGATCCAATGCTGGTGACCCTTGA  1241

Query 1221  CCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAACTATG  1294
            ||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1242  CCACCGCATTGCGGCCCTCACAGGCCTTGACATCCAGCCTCCCTACGCAGAGTATCTCCAGGTGGTGAACTATG  1315

Query 1295  GCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGAAGTCA  1368
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1316  GAATCGGAGGGCACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCGCCCAGCAGCCCCCTGTACAGAATGAAGTCT  1389

Query 1369  GGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATCTATGC  1442
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.
Sbjct 1390  GGGAACCGAGTGGCAACGTTTATGATCTATCTGAGCTCCGTAGAAGCTGGAGGAGCCACGGCTTTTATCTATGG  1463

Query 1443  CAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGGGGACA  1516
            ||||.||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..
Sbjct 1464  CAACTTCAGTGTGCCTGTGGTTAAGAATGCTGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGCGGAGAGGGGGATG  1537

Query 1517  GTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTAT  1590
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1538  GTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTGCTGGTGGGAGACAAGTGGGTGGCCAACAAGTGGATCCACGAGTAT  1611

Query 1591  GGACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGAC  1632
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1612  GGACAGGAATTCCGAAGACCCTGCAGCACCAACCCTGAAGAC  1653