Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: XR_001747836.1
• Aligned Length: 1912
• Identities: 1631
• Gaps: 280

Alignment

Query    1  -------------------------------------------ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGC  31
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCGCGGCCAGGACTGTCTGAGGGGAAGTTCGCGAGCGCTGGCTATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGC  74

Query   32  TGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACC  105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACC  148

Query  106  AGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGC  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGC  222

Query  180  GCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTA  253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTA  296

Query  254  ACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCC  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCC  370

Query  328  AGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGA  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGA  444

Query  402  GGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCT  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCT  518

Query  476  TTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGAC  592

Query  550  TGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGT  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGT  666

Query  624  CAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACT  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACT  740

Query  698  TGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGC  814

Query  772  CCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGT  888

Query  846  AGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGA  962

Query  920  CCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTAC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTAC  1036

Query  994  CTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAG  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAG  1110

Query 1068  TGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGA  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGA  1184

Query 1142  AGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTGACCCAAAACTGGTGACC  1258

Query 1216  CTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAA  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAA  1332

Query 1290  CTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGA  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGA  1406

Query 1364  AGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATC  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATC  1480

Query 1438  TATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGG  1511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGG  1554

Query 1512  GGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTG-----------------------  1562
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1555  GGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGCTCCCCATGAGGAGGTGGG  1628

Query 1563  --------------------------------------------------------------------------  1562
                                                                                      
Sbjct 1629  AAAACAAAGAAGAGATCAATAAGCAGATGGACGTGTTTATGTCACATATACATCCAGGAGCACTTAGCTCTGAA  1702

Query 1563  --------------------------------------------------------------------------  1562
                                                                                      
Sbjct 1703  ACAGAAAGAGAAGTGGAAGGGGGCTCATAAGCTGAGGTGGAGGCTGCCAGGAGATGCCACCCGTTTTTCTCTCA  1776

Query 1563  ---------------------------------------------GGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATG  1591
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTACTCTGGAATGGCTTCATGGGGAACATGGGCTTCTAAAATGAAGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATG  1850

Query 1592  GACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGAC---------------------  1632
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 1851  GACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGACTGAACTGTTGGCAGAGAGAAG  1912