Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16145
• Subject: XR_001747838.1
• Aligned Length: 1912
• Identities: 1481
• Gaps: 430

Alignment

Query    1  -------------------------------------------ATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGC  31
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  GCGCGGCCAGGACTGTCTGAGGGGAAGTTCGCGAGCGCTGGCTATGGGTCCTGGGGCGCGGCTGGCGGCGCTGC  74

Query   32  TGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACC  105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCGGTGCTGGCGCTCGGGACAGGAGACCCAGAAAGGGCTGCGGCTCGGGGCGACACGTTCTCGGCGCTGACC  148

Query  106  AGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGC  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCGTGGCGCGCGCCCTGGCGCCCGAGCGCCGGCTGCTGGGGCTGCTGAGGCGGTACCTGCGCGGGGAGGAGGC  222

Query  180  GCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTA  253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGCTGCGGGACCTGACTAGATTCTACGACAAGGTACTTTCTTTGCATGAGGATTCAACAACCCCTGTGGCTA  296

Query  254  ACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCC  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCCTCTGCTTGCATTTACTCTCATCAAACGCCTGCAGTCTGACTGGAGGAATGTGGTACATAGTCTGGAGGCC  370

Query  328  AGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGA  401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGAGAACATCCGAGCTCTGAAGGATGGCTATGAGAAGGTGGAGCAAGACCTTCCAGCCTTTGAGGACCTTGA  444

Query  402  GGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCT  475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGAGCAGCAAGGGCCCTGATGCGGCTGCAGGACGTGTACATGCTCAATGTGAAAGGCCTGGCCCGAGGTGTCT  518

Query  476  TTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGAC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCAGAGAGTCACTGGCTCTGCCATCACTGACCTGTACAGCCCCAAACGGCTCTTTTCTCTCACAGGGGATGAC  592

Query  550  TGCTTCCAAGTTGGCAAGGTGGCCTATGACATGGGGGATTATTACCATGCCATTCCATGGCTGGAGGAGGCTGT  623
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  593  TGCTTCCAAGTTGGCAA---------------------------------------------------------  609

Query  624  CAGTCTCTTCCGAGGATCTTACGGAGAGTGGAAGACAGAGGATGAGGCAAGTCTAGAAGATGCCTTGGATCACT  697
                                                                                      
Sbjct  610  --------------------------------------------------------------------------  609

Query  698  TGGCCTTTGCTTATTTCCGGGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGC  771
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  -------------------GGCAGGAAATGTTTCGTGTGCCCTCAGCCTCTCTCGGGAGTTTCTTCTCTACAGC  664

Query  772  CCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  CCAGATAATAAGAGGATGGCCAGGAATGTCTTGAAATATGAAAGGCTCTTGGCAGAGAGCCCCAACCACGTGGT  738

Query  846  AGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  AGCTGAGGCTGTCATCCAGAGGCCCAATATACCCCACCTGCAGACCAGAGACACCTACGAGGGGCTATGTCAGA  812

Query  920  CCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTAC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  CCCTGGGTTCCCAGCCCACTCTCTACCAGATCCCTAGCCTCTACTGTTCCTATGAGACCAATTCCAACGCCTAC  886

Query  994  CTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAG  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CTGCTGCTCCAGCCCATCCGGAAGGAGGTCATCCACCTGGAGCCCTACATTGCTCTCTACCATGACTTCGTCAG  960

Query 1068  TGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGA  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  TGACTCAGAGGCTCAGAAAATTAGAGAACTTGCAGAACCATGGCTACAGAGGTCAGTGGTGGCATCAGGGGAGA  1034

Query 1142  AGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTAACCCAAAACTGGTGACC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1035  AGCAGTTACAAGTGGAGTACCGCATCAGCAAAAGTGCCTGGCTGAAGGACACTGTTGACCCAAAACTGGTGACC  1108

Query 1216  CTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAA  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CTCAACCACCGCATTGCTGCCCTCACAGGCCTTGATGTCCGGCCTCCCTATGCAGAGTATCTGCAGGTGGTGAA  1182

Query 1290  CTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGA  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  CTATGGCATCGGAGGACACTATGAGCCTCACTTTGACCATGCTACGTCACCAAGCAGCCCCCTCTACAGAATGA  1256

Query 1364  AGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATC  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  AGTCAGGAAACCGAGTTGCAACATTTATGATCTATCTGAGCTCGGTGGAAGCTGGAGGAGCCACAGCCTTCATC  1330

Query 1438  TATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGG  1511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  TATGCCAACCTCAGCGTGCCTGTGGTTAGGAATGCAGCACTGTTTTGGTGGAACCTGCACAGGAGTGGTGAAGG  1404

Query 1512  GGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTG-----------------------  1562
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1405  GGACAGTGACACACTTCATGCTGGCTGTCCTGTCCTGGTGGGAGATAAGTGGGTGCTCCCCATGAGGAGGTGGG  1478

Query 1563  --------------------------------------------------------------------------  1562
                                                                                      
Sbjct 1479  AAAACAAAGAAGAGATCAATAAGCAGATGGACGTGTTTATGTCACATATACATCCAGGAGCACTTAGCTCTGAA  1552

Query 1563  --------------------------------------------------------------------------  1562
                                                                                      
Sbjct 1553  ACAGAAAGAGAAGTGGAAGGGGGCTCATAAGCTGAGGTGGAGGCTGCCAGGAGATGCCACCCGTTTTTCTCTCA  1626

Query 1563  ---------------------------------------------GGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATG  1591
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  GTACTCTGGAATGGCTTCATGGGGAACATGGGCTTCTAAAATGAAGGTGGCCAACAAGTGGATACATGAGTATG  1700

Query 1592  GACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGAC---------------------  1632
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 1701  GACAGGAATTCCGCAGACCCTGCAGCTCCAGCCCTGAAGACTGAACTGTTGGCAGAGAGAAG  1762