Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_16176
• Subject: XM_006511196.3
• Aligned Length: 1182
• Identities: 999
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC  74
                                                                           ..||  |||| 
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGA--AGCT-  8

Query   75  TGCGGA---GACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGC  145
               |||   |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct    9  ---GGAGAGGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGC  79

Query  146  GCCTTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAG  219
            |.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct   80  GGCTCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAA  153

Query  220  CTGGGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCT  293
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  154  CTGGGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCT  227

Query  294  AATTCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACT  367
            .||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  228  GATCCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACT  301

Query  368  CTCCGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGAT  441
            |.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  302  CCCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGAT  375

Query  442  GGAGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGC  515
            ||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  GGTGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGC  449

Query  516  TGTAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATCC  589
            |||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  450  TGTGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATTC  523

Query  590  TAGTCAACTCCCGTGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACGACATGGCCAAC  663
            ||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||...|||||||||
Sbjct  524  TAGTGAACTCACGTGGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCAAC  597

Query  664  GACTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGACAT  737
            ..||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  598  TCCTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGACAT  671

Query  738  CTGGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGAGC  811
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  672  CTGGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGAGC  745

Query  812  TGGAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGAGG  885
            |||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  746  TGGAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGAGG  819

Query  886  CCCCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAACGA  959
            ||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  820  CCTCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAATGA  893

Query  960  GCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAAA  1033
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  894  GCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAGA  967

Query 1034  ACCCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAGTG  1107
            ||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  968  ACCCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGGTA  1041

Query 1108  GATTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC  1179
            ||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1042  GACTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC  1113