Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00010
- Subject:
- NM_002197.3
- Aligned Length:
- 2667
- Identities:
- 2667
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAGCAACCCATTCGCACACCTTGCTGAGCCATTGGATCCTGTACAACCAGGAAAGAAATTCTTCAATTTGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAACCCATTCGCACACCTTGCTGAGCCATTGGATCCTGTACAACCAGGAAAGAAATTCTTCAATTTGAA 74
Query 75 TAAATTGGAGGATTCAAGATATGGGCGCTTACCATTTTCGATCAGAGTTCTTCTGGAAGCAGCCATTCGGAATT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAATTGGAGGATTCAAGATATGGGCGCTTACCATTTTCGATCAGAGTTCTTCTGGAAGCAGCCATTCGGAATT 148
Query 149 GTGATGAGTTTTTGGTGAAGAAACAGGATATTGAAAATATTCTACATTGGAATGTCACGCAGCACAAGAACATA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTGATGAGTTTTTGGTGAAGAAACAGGATATTGAAAATATTCTACATTGGAATGTCACGCAGCACAAGAACATA 222
Query 223 GAAGTGCCATTTAAGCCTGCTCGTGTCATCCTGCAGGACTTTACGGGTGTGCCCGCTGTGGTTGACTTTGCTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGTGCCATTTAAGCCTGCTCGTGTCATCCTGCAGGACTTTACGGGTGTGCCCGCTGTGGTTGACTTTGCTGC 296
Query 297 AATGCGTGATGCTGTGAAAAAGTTAGGAGGAGATCCAGAGAAAATAAACCCTGTCTGCCCTGCTGATCTTGTAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AATGCGTGATGCTGTGAAAAAGTTAGGAGGAGATCCAGAGAAAATAAACCCTGTCTGCCCTGCTGATCTTGTAA 370
Query 371 TAGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAATTTGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAATTTGAA 444
Query 445 AGAAATAGAGAGCGATTTGAATTTTTAAAGTGGGGTTCCCAGGCTTTTCACAACATGCGGATTATTCCCCCTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGAAATAGAGAGCGATTTGAATTTTTAAAGTGGGGTTCCCAGGCTTTTCACAACATGCGGATTATTCCCCCTGG 518
Query 519 CTCAGGAATCATCCACCAGGTGAATTTGGAATATTTGGCAAGAGTGGTATTTGATCAGGATGGATATTATTACC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCAGGAATCATCCACCAGGTGAATTTGGAATATTTGGCAAGAGTGGTATTTGATCAGGATGGATATTATTACC 592
Query 593 CAGACAGCCTCGTGGGCACAGACTCGCACACTACCATGATTGATGGCTTGGGCATTCTTGGTTGGGGTGTCGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGACAGCCTCGTGGGCACAGACTCGCACACTACCATGATTGATGGCTTGGGCATTCTTGGTTGGGGTGTCGGT 666
Query 667 GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCAATCAGTATGGTGCTTCCTCAGGTGATTGGCTACAGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCAATCAGTATGGTGCTTCCTCAGGTGATTGGCTACAGGCT 740
Query 741 GATGGGGAAGCCCCACCCTCTGGTAACATCCACTGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGCCAGGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGGGGAAGCCCCACCCTCTGGTAACATCCACTGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGCCAGGTTG 814
Query 815 GGGTAGTGGGCAAATTTGTCGAGTTCTTCGGGCCTGGAGTAGCCCAGTTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGTAGTGGGCAAATTTGTCGAGTTCTTCGGGCCTGGAGTAGCCCAGTTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT 888
Query 889 GCTAACATGTGTCCAGAGTACGGAGCAACTGCTGCCTTTTTCCCAGTTGATGAAGTTAGTATCACGTACCTGGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTAACATGTGTCCAGAGTACGGAGCAACTGCTGCCTTTTTCCCAGTTGATGAAGTTAGTATCACGTACCTGGT 962
Query 963 GCAAACAGGTCGTGATGAAGAAAAATTAAAGTATATTAAAAAATATCTTCAGGCTGTAGGAATGTTTCGAGATT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAAACAGGTCGTGATGAAGAAAAATTAAAGTATATTAAAAAATATCTTCAGGCTGTAGGAATGTTTCGAGATT 1036
Query 1037 TCAATGACCCTTCTCAAGACCCAGACTTCACCCAGGTTGTGGAATTAGATTTGAAAACAGTAGTGCCTTGCTGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAATGACCCTTCTCAAGACCCAGACTTCACCCAGGTTGTGGAATTAGATTTGAAAACAGTAGTGCCTTGCTGT 1110
Query 1111 AGTGGACCCAAAAGGCCTCAGGACAAAGTTGCTGTGTCCGACATGAAAAAGGACTTTGAGAGCTGCCTTGGAGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTGGACCCAAAAGGCCTCAGGACAAAGTTGCTGTGTCCGACATGAAAAAGGACTTTGAGAGCTGCCTTGGAGC 1184
Query 1185 CAAGCAAGGATTTAAAGGATTCCAAGTTGCTCCTGAACATCATAATGACCATAAGACCTTTATCTATGATAACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAAGCAAGGATTTAAAGGATTCCAAGTTGCTCCTGAACATCATAATGACCATAAGACCTTTATCTATGATAACA 1258
Query 1259 CTGAATTCACCCTTGCTCATGGTTCTGTGGTCATTGCTGCCATTACTAGCTGCACAAACACCAGTAATCCGTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGAATTCACCCTTGCTCATGGTTCTGTGGTCATTGCTGCCATTACTAGCTGCACAAACACCAGTAATCCGTCT 1332
Query 1333 GTGATGTTAGGGGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGATGCTGGCCTGAACGTGATGCCTTACATCAAAAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGATGTTAGGGGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGATGCTGGCCTGAACGTGATGCCTTACATCAAAAC 1406
Query 1407 TAGCCTGTCTCCTGGGAGTGGCGTGGTCACCTACTACCTACAAGAAAGCGGAGTCATGCCTTATCTGTCTCAGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAGCCTGTCTCCTGGGAGTGGCGTGGTCACCTACTACCTACAAGAAAGCGGAGTCATGCCTTATCTGTCTCAGC 1480
Query 1481 TTGGGTTTGACGTGGTGGGCTATGGCTGCATGACCTGCATTGGCAACAGTGGGCCTTTACCTGAACCTGTGGTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTGGGTTTGACGTGGTGGGCTATGGCTGCATGACCTGCATTGGCAACAGTGGGCCTTTACCTGAACCTGTGGTA 1554
Query 1555 GAAGCCATCACACAGGGAGACCTTGTAGCTGTTGGAGTACTATCTGGAAACAGGAATTTTGAAGGTCGAGTTCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGCCATCACACAGGGAGACCTTGTAGCTGTTGGAGTACTATCTGGAAACAGGAATTTTGAAGGTCGAGTTCA 1628
Query 1629 CCCCAACACCCGGGCCAACTATTTAGCCTCTCCCCCCTTAGTAATAGCATATGCAATTGCTGGAACCATCAGAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCCCAACACCCGGGCCAACTATTTAGCCTCTCCCCCCTTAGTAATAGCATATGCAATTGCTGGAACCATCAGAA 1702
Query 1703 TCGACTTTGAGAAAGAGCCATTGGGAGTAAATGCAAAGGGACAGCAGGTATTTCTGAAAGATATCTGGCCGACT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCGACTTTGAGAAAGAGCCATTGGGAGTAAATGCAAAGGGACAGCAGGTATTTCTGAAAGATATCTGGCCGACT 1776
Query 1777 AGAGACGAGATCCAGGCAGTGGAGCGTCAGTATGTCATCCCGGGGATGTTTAAGGAAGTCTATCAGAAAATAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGAGACGAGATCCAGGCAGTGGAGCGTCAGTATGTCATCCCGGGGATGTTTAAGGAAGTCTATCAGAAAATAGA 1850
Query 1851 GACTGTGAATGAAAGCTGGAATGCCTTAGCAACCCCATCAGATAAGCTGTTTTTCTGGAATTCCAAATCTACGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GACTGTGAATGAAAGCTGGAATGCCTTAGCAACCCCATCAGATAAGCTGTTTTTCTGGAATTCCAAATCTACGT 1924
Query 1925 ATATCAAATCACCACCATTCTTTGAAAACCTGACTTTGGATCTTCAGCCCCCTAAATCTATAGTGGATGCCTAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATATCAAATCACCACCATTCTTTGAAAACCTGACTTTGGATCTTCAGCCCCCTAAATCTATAGTGGATGCCTAT 1998
Query 1999 GTGCTGCTAAATTTGGGAGATTCGGTAACAACTGACCACATCTCCCCAGCTGGAAATATTGCAAGAAACAGTCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGCTGCTAAATTTGGGAGATTCGGTAACAACTGACCACATCTCCCCAGCTGGAAATATTGCAAGAAACAGTCC 2072
Query 2073 TGCTGCTCGCTACTTAACTAACAGAGGCCTAACTCCACGAGAATTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGAGGTAATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGCTGCTCGCTACTTAACTAACAGAGGCCTAACTCCACGAGAATTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGAGGTAATG 2146
Query 2147 ACGCCGTCATGGCACGGGGAACATTTGCCAACATTCGCTTGTTAAACAGATTTTTGAACAAGCAGGCACCACAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACGCCGTCATGGCACGGGGAACATTTGCCAACATTCGCTTGTTAAACAGATTTTTGAACAAGCAGGCACCACAG 2220
Query 2221 ACTATCCATCTGCCTTCTGGGGAAATCCTTGATGTGTTTGATGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCAGGCCTTCC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACTATCCATCTGCCTTCTGGGGAAATCCTTGATGTGTTTGATGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCAGGCCTTCC 2294
Query 2295 CCTGATCGTTCTGGCTGGCAAAGAGTACGGTGCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCTAAGGGCCCTTTCCTGC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CCTGATCGTTCTGGCTGGCAAAGAGTACGGTGCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCTAAGGGCCCTTTCCTGC 2368
Query 2369 TGGGAATCAAAGCCGTCCTGGCCGAGAGCTACGAGCGCATTCACCGCAGTAACCTGGTTGGGATGGGTGTGATC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGGGAATCAAAGCCGTCCTGGCCGAGAGCTACGAGCGCATTCACCGCAGTAACCTGGTTGGGATGGGTGTGATC 2442
Query 2443 CCACTTGAATATCTCCCTGGTGAGAATGCAGATGCCCTGGGGCTCACAGGGCAAGAACGATACACTATCATTAT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CCACTTGAATATCTCCCTGGTGAGAATGCAGATGCCCTGGGGCTCACAGGGCAAGAACGATACACTATCATTAT 2516
Query 2517 TCCAGAAAACCTCAAACCACAAATGAAAGTCCAGGTCAAGCTGGATACTGGCAAGACCTTCCAGGCTGTCATGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCAGAAAACCTCAAACCACAAATGAAAGTCCAGGTCAAGCTGGATACTGGCAAGACCTTCCAGGCTGTCATGA 2590
Query 2591 GGTTTGACACTGATGTGGAGCTCACTTATTTCCTCAACGGGGGCATCCTCAACTACATGATCCGCAAGATGGCC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GGTTTGACACTGATGTGGAGCTCACTTATTTCCTCAACGGGGGCATCCTCAACTACATGATCCGCAAGATGGCC 2664
Query 2665 AAG 2667
|||
Sbjct 2665 AAG 2667