Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00016
- Subject:
- NM_001102.4
- Aligned Length:
- 911
- Identities:
- 767
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENI 74
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Sbjct 1 -MDHYDSQQT------------------NDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENI 55
Query 75 DEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWT 148
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Sbjct 56 EEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWT 129
Query 149 IILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVT 222
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Sbjct 130 IILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLT 203
Query 223 NLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLME 296
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Sbjct 204 NLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLME 277
Query 297 DYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRP 370
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Sbjct 278 DYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMHAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRP 351
Query 371 AFMPSEGKMVSDINNGWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETA 444
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Sbjct 352 AFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQVEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLRQKDYETA 425
Query 445 TLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEK 518
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Sbjct 426 TLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALER 499
Query 519 TEKQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADREREAILAIHK 592
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Sbjct 500 TEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHN 573
Query 593 EAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEHLRRQFASQANVVGPWIQ 666
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Sbjct 574 EVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQ 647
Query 667 TKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLL 740
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Sbjct 648 TKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLL 721
Query 741 TTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKDHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQGEAEFNRI 814
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Sbjct 722 TTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARI 795
Query 815 MSLVDPNHSGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQG 888
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Sbjct 796 MSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITMDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTG 869
Query 889 PDAVPGALDYKSFSTALYGESDL 911
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Sbjct 870 PDSVPGALDYMSFSTALYGESDL 892