Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00016
• Subject: XM_005259281.5
• Aligned Length: 2746
• Identities: 2693
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG  74
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Sbjct    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG  74

Query   75  GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA  148

Query  149  AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT  222

Query  223  GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC  296

Query  297  GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG  370

Query  371  TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC  444

Query  445  ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG  518
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Sbjct  445  ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG  518

Query  519  CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT  592
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Sbjct  519  CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT  592

Query  593  TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC  666

Query  667  AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT  740
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Sbjct  667  AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT  740

Query  741  GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGCGC  814
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Sbjct  741  GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGCGC  814

Query  815  AGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGGAG  888
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Sbjct  815  AGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGGAG  888

Query  889  GACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTGCC  962
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Sbjct  889  GACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTGCC  962

Query  963  CCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCCCA  1036

Query 1037  AGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGCCC  1110
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Sbjct 1037  AGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGCCC  1110

Query 1111  GCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCTGAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCTGAGAA  1184

Query 1185  GGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGC  1258

Query 1259  AGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGACGGCC  1332
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Sbjct 1259  AGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGACGGCC  1332

Query 1333  ACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGGACCG  1406
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Sbjct 1333  ACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGGACCG  1406

Query 1407  CGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAACACCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAACACCC  1480

Query 1481  GGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGAGAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGAGAAA  1554

Query 1555  ACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACAACTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACAACTG  1628

Query 1629  GATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTGATCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTGATCT  1702

Query 1703  CAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCACAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCACAAG  1776

Query 1777  GAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCCCGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCCCGCA  1850

Query 1851  AATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGAGCAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGAGCAGA  1924

Query 1925  GCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGATCCAG  1998
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Sbjct 1925  GCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGATCCAG  1998

Query 1999  ACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACCTGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACCTGAA  2072

Query 2073  GCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATCCAGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATCCAGG  2146

Query 2147  AGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTC  2220
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Sbjct 2147  AGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTC  2220

Query 2221  ACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGA  2294
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Sbjct 2221  ACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGA  2294

Query 2295  GCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGC-TGGGGCCCGAGGAG  2367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|| |.|.||..|| |||...||||.||.
Sbjct 2295  GCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGAAGCA-GACAGGCAGCATGGACTCCGATGAC  2367

Query 2368  TTCAAGGC-CTGC----CTC------AT-CAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGA  2429
            ||||.||| ||||    |||      || ||||||                           ||||||||||||
Sbjct 2368  TTCAGGGCTCTGCTTATCTCCACAGGATACAGCCT---------------------------GGGTGAGGCCGA  2414

Query 2430  GTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCA  2503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415  GTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCA  2488

Query 2504  TGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAG  2577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489  TGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAG  2562

Query 2578  AACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGC  2651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563  AACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGC  2636

Query 2652  GCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGA  2725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637  GCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGA  2710

Query 2726  GCGACCTG  2733
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Sbjct 2711  GCGACCTG  2718