Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00050
• Subject: NM_001030010.3
• Aligned Length: 1404
• Identities: 1293
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT  74

Query   75  CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC  148

Query  149  AGGACCTGCACAAGTCAGCCTTCGAGTCGGAGGTGTCTGAGGTTGCCATCAGCCAGGGCGAGGTCACCCTGGCC  222
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  149  AGGACCTGCACAA-------------------------------------------------------------  161

Query  223  CTCAGGAACCTCCGGGCCTGGATGAAGGACGAGCGTGTGCCCAAGAACCTGGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT  296
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  --------------------------------------------------GGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT  185

Query  297  CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186  CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC  259

Query  371  CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG  333

Query  445  ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC  407

Query  519  GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA  481

Query  593  CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC  555

Query  667  TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC  629

Query  741  CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT  703

Query  815  ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA  777

Query  889  TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT  851

Query  963  GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC  925

Query 1037  AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC  999

Query 1111  AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT  1073

Query 1185  GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG  1147

Query 1259  ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG  1221

Query 1333  CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC  1293