Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00051
• Subject: NM_000694.4
• Aligned Length: 1404
• Identities: 1293
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT  74

Query   75  CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC  148

Query  149  AGGACCTGCACAA-------------------------------------------------------------  161
            |||||||||||||                                                             
Sbjct  149  AGGACCTGCACAAGTCAGCCTTCGAGTCGGAGGTGTCTGAGGTTGCCATCAGCCAGGGCGAGGTCACCCTGGCC  222

Query  162  --------------------------------------------------GGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT  185
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCAGGAACCTCCGGGCCTGGATGAAGGACGAGCGTGTGCCCAAGAACCTGGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT  296

Query  186  CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC  370

Query  260  CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG  444

Query  334  ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC  518

Query  408  GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA  592

Query  482  CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC  666

Query  556  TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC  740

Query  630  CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT  814

Query  704  ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA  888

Query  778  TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT  962

Query  852  GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC  1036

Query  926  AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC  1110

Query 1000  AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT  1184

Query 1074  GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG  1258

Query 1148  ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG  1332

Query 1222  CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC  1404