Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00052
• Subject: NM_001369146.1
• Aligned Length: 1529
• Identities: 1256
• Gaps: 262

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA  74

Query   75  GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT  148

Query  149  GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT  222

Query  223  CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC  296

Query  297  ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG  370

Query  371  GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA  444

Query  445  AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT  518

Query  519  CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG  592

Query  593  CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG  666

Query  667  GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT  740

Query  741  TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA  814

Query  815  ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA  888

Query  889  GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT  962

Query  963  TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG  1036

Query 1037  ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC  1110

Query 1111  ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA  1184

Query 1185  CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTGGGTTCCAGTGGGATGGGAGCTTATCACGGAA-AACATAGTTTTGATACTTTT  1257
            ||||||||||||||||||||||              ||.||..|||.||.||| ||        ||||      
Sbjct 1185  CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTG--------------GGCAGAATATTACTGAAGAA--------TGAT------  1230

Query 1258  TCTCATCAGCGTCCCTGTTTATTAAAAAGTTTAAAGAGAGAAGGTGCTAACAAACTCAGATATCCTCCCAACAG  1331
                         ||||||                               |||          |||||.|    
Sbjct 1231  -------------CCTGTT-------------------------------CAA----------CCTCCTA----  1246

Query 1332  CCAGTCAAAGGTG----GATTGGGGAAAATTTTTTCTCTTGAAACGGTTCAACAAAGAAAAACTCGGTCTCCTG  1401
                      |||    .|.||     ||||.||.|||||.                                 
Sbjct 1247  ----------GTGCCTCTACTG-----AATTATTCCTCTTT---------------------------------  1272

Query 1402  TTGCTCACTTTCCTGGGTATTGTAGCCGCTGTGCTTGTCAAGAAATACCAAGCTGTGCTGAGGAGAAAGGCCCT  1475
                                                                                      
Sbjct 1273  --------------------------------------------------------------------------  1272

Query 1476  GTTGATTTTTCTGGTAGTTCACAGACTGCGTTGGTCCAGTAAGCAGAGA  1524
                                                             
Sbjct 1273  -------------------------------------------------  1272